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Enregistrement W2761313540 · doi:10.1093/infdis/jix526

Beyond Antigenic Match: Possible Agent-Host and Immuno-epidemiological Influences on Influenza Vaccine Effectiveness During the 2015–2016 Season in Canada

2017· article· en· W2761313540 sur OpenAlexaffabout
Danuta M. Skowronski, Catharine Chambers, Suzana Sabaiduc, Gaston De Serres, Anne‐Luise Winter, James A. Dickinson, Jonathan B. Gubbay, Steven J. Drews, Christine Martineau, Hugues Charest, Mel Krajden, Nathalie Bastien, Yan Li

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Infectious Diseases · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInfluenza Virus Research Studies
Établissements canadiensPublic Health Agency of CanadaProvincial Laboratory of Public HealthUniversity of TorontoUniversity of CalgaryUniversity of AlbertaUniversité LavalInstitut National de Santé Publique du QuébecCentre hospitalier universitaire de QuébecPublic Health OntarioBC Centre for Disease ControlUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHost (biology)VirologyEpidemiologyAntigenInfluenza vaccineImmunologyBiologyVaccinationMedicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Vaccine effectiveness (VE) estimates for 2015-2016 seasonal influenza vaccine are reported from Canada's Sentinel Practitioner Surveillance Network (SPSN). This season was characterized by a delayed 2009 pandemic influenza A(H1N1) virus (A[H1N1]pdm09) epidemic and concurrent influenza B(Victoria) virus activity. Potential influences on VE beyond antigenic match are explored, including viral genomic variation, birth cohort effects, prior vaccination, and epidemic period. Methods: VE was estimated by a test-negative design comparing the adjusted odds ratio for influenza test positivity among vaccinated compared to unvaccinated participants. Vaccine-virus relatedness was assessed by gene sequencing and hemagglutination inhibition assay. Results: Analyses included 596 influenza A(H1N1)pdm09 and 305 B(Victoria) cases and 926 test-negative controls. A(H1N1)pdm09 viruses were considered antigenically related to vaccine (unchanged since 2009), despite phylogenetic clustering within emerging clade 6B.1. The adjusted VE against A(H1N1)pdm09 was 43% (95% confidence interval [CI], 25%-57%). Compared to other age groups, VE against A(H1N1)pdm09 was lower for adults born during 1957-1976 (25%; 95% CI, -16%-51%). The VE against A(H1N1)pdm09 was also lower for participants consecutively vaccinated during both the current and prior seasons (41%; 95% CI, 18%-57%) than for those vaccinated during the current season only (75%; 95% CI, 45%-88%), and the VE among participants presenting in March-April 2016 (19%; 95% CI, -15%-44%) was lower than that among those presenting during January-February 2016 (62%; 95% CI, 44%-74%). The adjusted VE for B(Victoria) viruses was 54% (95% CI, 32%-68%), despite lineage-level mismatch to B(Yamagata) vaccine. The further variation in VE as observed for A(H1N1)pdm09 was not observed for B(Victoria). Conclusions: Influenza VE findings may require consideration of other agent-host and immuno-epidemiologic influences on vaccine performance beyond antigenic match, including viral genomic variation, repeat vaccination, birth (immunological) cohort effects, and potential within-season waning of vaccine protection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,093
Score d'incertitude au seuil0,954

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,352
Écart entre enseignants0,320 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations116
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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