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Enregistrement W2761344822

Evidence of very low genetic diversity of cuban gar (Atractosteus tristoechus)/ Evidencia de pobre diversidad genética del manjuarí (Atractosteus tristoechus)

2016· article· en· W2761344822 sur OpenAlexaff
Gabriela Ulmo‐Diaz, Jessy Castellanos-Gell, José Luis Ponce de León, Didier Casañe, Andrés Hurtado, Erik García‐Machado

Notice bibliographique

RevueDOAJ (DOAJ: Directory of Open Access Journals) · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueFish biology, ecology, and behavior
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGenetic diversityDiversity (politics)GeographyBiologySociologyAnthropologyDemographyPopulation
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Cuban gar (Atractosteus tristoechus) is an endemic freshwater fish species of Cuba. Among the Lepisosteiformes, this species is one of the most threatened and has the lowest natural distribution range. It is restricted to the southwestern region of the Cuban archipelago. This research is focused on the genetic characterization of captive and wild populations of Zapata Swamp, using two mitochondrial sequences (one in the gene coding cytochrome c oxidase I and the other in the Control Region) and nine microsatellite loci. A total of 47 individuals were included in the study. Low genetic variability was detected: h = 0.202 ± 0.077 and π = 0.0002 ± 0.00008 for mitochondrial sequences; Ho = 0.016 and He=0.025 for microsatellites. Among lepisosteids studied so far, this species showed the lowest genetic diversity. The results suggest that A. tristoechus had a low effective population size over a long period of time and/or the population went through a recent bottleneck. Given the recent demographic trend of this species and the low genetic diversity revealed in the present study, special attention and conservation efforts are urgently needed. RESUMEN El manjuarí (Atractosteus tristoechus) es un pez de agua dulce endémico de Cuba. Entre los Lepisosteiformes, esta especie es una de las más amenazadas y ocupa la menor área de distribución natural. Está restringida al área suroeste del archipiélago cubano. Esta investigación se enfoca en la caracterización genética de las poblaciones cautivas y naturales de la Ciénaga de Zapata, mediante dos secuencias mitocondriales (gen que codifica citocromo c oxidasa I y la Región de Control) y nueve loci microsatélite. Un total de 47 individuos fueron incluidos en la investigación. Se detectó baja variabilidad genética: h = 0.202 ± 0.077 y π = 0.00021 ± 0.00008 para las secuencias mitocondriales; Ho=0.016 y He=0.025 para los microsatélites. Entre los lepisosteidos estudiados hasta el momento, esta especie muestra la menor variabilidad genética. Estos resultados sugieren que A. tristoechus ha mantenido un pequeño tamaño efectivo poblacional durante largo tiempo y/o la población ha experimentado un cuello de botella reciente. Dada la reciente tendencia demográfica de la especie, y la baja diversidad genética mostrada en este estudio, se hace necesaria con urgencia una atención especial, así como esfuerzos para su conservación.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,031

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,176
Tête enseignante GPT0,457
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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