Evidence of very low genetic diversity of cuban gar (Atractosteus tristoechus)/ Evidencia de pobre diversidad genética del manjuarí (Atractosteus tristoechus)
Notice bibliographique
Résumé
The Cuban gar (Atractosteus tristoechus) is an endemic freshwater fish species of Cuba. Among the Lepisosteiformes, this species is one of the most threatened and has the lowest natural distribution range. It is restricted to the southwestern region of the Cuban archipelago. This research is focused on the genetic characterization of captive and wild populations of Zapata Swamp, using two mitochondrial sequences (one in the gene coding cytochrome c oxidase I and the other in the Control Region) and nine microsatellite loci. A total of 47 individuals were included in the study. Low genetic variability was detected: h = 0.202 ± 0.077 and π = 0.0002 ± 0.00008 for mitochondrial sequences; Ho = 0.016 and He=0.025 for microsatellites. Among lepisosteids studied so far, this species showed the lowest genetic diversity. The results suggest that A. tristoechus had a low effective population size over a long period of time and/or the population went through a recent bottleneck. Given the recent demographic trend of this species and the low genetic diversity revealed in the present study, special attention and conservation efforts are urgently needed. RESUMEN El manjuarí (Atractosteus tristoechus) es un pez de agua dulce endémico de Cuba. Entre los Lepisosteiformes, esta especie es una de las más amenazadas y ocupa la menor área de distribución natural. Está restringida al área suroeste del archipiélago cubano. Esta investigación se enfoca en la caracterización genética de las poblaciones cautivas y naturales de la Ciénaga de Zapata, mediante dos secuencias mitocondriales (gen que codifica citocromo c oxidasa I y la Región de Control) y nueve loci microsatélite. Un total de 47 individuos fueron incluidos en la investigación. Se detectó baja variabilidad genética: h = 0.202 ± 0.077 y π = 0.00021 ± 0.00008 para las secuencias mitocondriales; Ho=0.016 y He=0.025 para los microsatélites. Entre los lepisosteidos estudiados hasta el momento, esta especie muestra la menor variabilidad genética. Estos resultados sugieren que A. tristoechus ha mantenido un pequeño tamaño efectivo poblacional durante largo tiempo y/o la población ha experimentado un cuello de botella reciente. Dada la reciente tendencia demográfica de la especie, y la baja diversidad genética mostrada en este estudio, se hace necesaria con urgencia una atención especial, así como esfuerzos para su conservación.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».