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Enregistrement W2761464308 · doi:10.1111/tpj.13745

An Arabidopsis divergent pumilio protein, <scp>APUM</scp>24, is essential for embryogenesis and required for faithful pre‐<scp>rRNA</scp> processing

2017· article· en· W2761464308 sur OpenAlexaff
Thiruvenkadam Shanmugam, Nazia Abbasi, Hyung‐Sae Kim, Ho Bang Kim, Nam Il Park, Guen Tae Park, Sung Aeong Oh, Soon Ki Park, Douglas G. Muench, Yeonhee Choi, Youn‐Il Park, Sang‐Bong Choi

Notice bibliographique

RevueThe Plant Journal · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Molecular Biology Research
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesRural Development AdministrationNational Science Foundation, United Arab EmiratesNational Research Foundation
Mots-clésBiologyArabidopsisCell biologyRNARNA-binding proteinCell divisionEmbryoMutantGeneticsCellGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pumilio RNA-binding proteins are largely involved in mRNA degradation and translation repression. However, a few evolutionarily divergent Pumilios are also responsible for proper pre-rRNA processing in human and yeast. Here, we describe an essential Arabidopsis nucleolar Pumilio, APUM24, that is expressed in tissues undergoing rapid proliferation and cell division. A T-DNA insertion for APUM24 did not affect the male and female gametogenesis, but instead resulted in a negative female gametophytic effect on zygotic cell division immediately after fertilization. Additionally, the mutant embryos displayed defects in cell patterning from pro-embryo through globular stages. The mutant embryos were marked by altered auxin maxima, which were substantiated by the mislocalization of PIN1 and PIN7 transporters in the defective embryos. Homozygous apum24 callus accumulates rRNA processing intermediates, including uridylated and adenylated 5.8S and 25S rRNA precursors. An RNA-protein interaction assay showed that the histidine-tagged recombinant APUM24 binds RNAin vitro with no apparent specificity. Overall, our results demonstrated that APUM24 is required for rRNA processing and early embryogenesis in Arabidopsis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesÉtudes des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,251
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0030,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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