Parasites of invasive crustacea: risks and opportunities for control
Notice bibliographique
Résumé
Invasive species are one of the foremost damaging environmental problems for biodiversity and conservation, and can affect human health and man-made structures. They pose a great challenge for pest management, with little known about their control and few available success stories. Many crustacean species are invasive and can affect both biodiversity and aquaculture. Controlling invasive Crustacea is a complex and arduous process, but success could lead to increased environmental protection and conservation. Invasive Crustacea also comprise a significant pathway for the introduction of invasive pathogens. If these invaders carry pathogens, parasites or commensals to a new site they may threaten native species. Alternatively, pathogens can control their invasive host and could be utilised in a targeted biological control effort as a biocontrol agent. \nLooking specifically at one species of invasive brachyuran crab (Carcinus maenas) collected from the UK, Faroes Islands and Atlantic Canada, and several species of invasive amphipod from the UK and Poland, I explore which groups of microorganisms are carried alongside invasions, and if any could be used as biocontrol agents or whether they pose a threat to native wildlife. \nThis thesis involves wide-scale screening of Carcinus maenas and several amphipod species, identifying a range of metazoans, fungi, protozoa, bacteria and viruses; many new to science. Taxonomic descriptions are provided for previously unknown taxa: Parahepatospora carcini; Cucumispora ornata; Cucumispora roeselii; and Aquarickettsiella crustaci. The application of metagenomics to pathogen invasion ecology is also explored, determining that it can be used as an early screening system to detect rare and/or asymptomatic microbial associations. Finally, I used experimental systems to assess the impact of pathogens carried by Dikerogammarus haemobaphes upon both itself and alternate host species (Dikerogammarus villosus and Gammarus pulex), identifying that C. ornata can infect native species and decrease their chance of survival. \nOverall this thesis describes a research process following through three main steps: i) invasive pathogen detection, ii) taxonomic identification, and iii) host range and pathological risk assessment and impact. Screening invasive and non-native hosts for pathogens is recommended for invasive species entering the UK, to provide a fast and informed risk assessment process for hazardous hitchhiking microbes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,003 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,010 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».