A tuneable microfluidic system for long duration chemotaxis experiments in a 3D collagen matrix
Notice bibliographique
Résumé
In many cell types, migration can be oriented towards a chemical stimulus. In mammals, for example, embryonic cells migrate to follow developmental cues, immune cells migrate toward sites of inflammation, and cancer cells migrate away from the primary tumour and toward blood vessels during metastasis. Understanding how cells migrate in 3D environments in response to chemical cues is thus crucial to understanding directed migration in normal and disease states. To date, chemotaxis in mammalian cells has been primarily studied using 2D migration models. However, it is becoming increasingly clear that the mechanisms by which cells migrate in 2D and 3D environments dramatically differ, and cells in their native environments are confronted with a complex chemical milieu. To address these issues, we developed a microfluidic device to monitor the behaviour of cells embedded in a 3D collagen matrix in the presence of complex concentration fields of chemoattractants. This tuneable microsystem enables the generation of (1) homogeneous, stationary gradients set by a purely diffusive mechanism, or (2) spatially evolving, stationary gradients, set by a convection-diffusion mechanism. The device allows for stable gradients over several days and is large enough to study the behaviour of large cell aggregates. We observe that primary mature dendritic cells respond uniformly to homogeneous diffusion gradients, while cell behaviour is highly position-dependent in spatially variable convection-diffusion gradients. In addition, we demonstrate a directed response of cancer cells migrating away from tumour-like aggregates in the presence of soluble chemokine gradients. Together, this microfluidic device is a powerful system to observe the response of different cells and aggregates to tuneable chemical gradients.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».