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Enregistrement W2762330905 · doi:10.1038/s41467-017-01381-y

CCDC88B is required for pathogenesis of inflammatory bowel disease

2017· article· en· W2762330905 sur OpenAlexafffund
Nassima Fodil, Neda Moradin, Vicki Leung, Jean-Frederic Olivier, Irena Radovanovic, Thiviya Jeyakumar, Manuel Flores Molina, Ashley McFarquhar, Romain Cayrol, Dominique Bozec, Naglaa H. Shoukry, Michiaki Kubo, Julia Dimitrieva, Édouard Louis, Emilie Théâtre, Stéphanie Dahan, Yukihide Momozawa, Michel Georges, Garabet Yeretssian, Philippe Gros

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensMcGill Genome CentreUniversité de MontréalCentre Hospitalier de l’Université de MontréalMcGill University
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéSwedish Orphan BiovitrumMcGill UniversityUniversité de MontréalCanadian Institutes of Health ResearchWalloon excellence in life sciences and biotechnologyLeona M. and Harry B. Helmsley Charitable TrustBelgian Federal Science Policy OfficeStyrelsen för Internationellt Utvecklingssamarbete
Mots-clésInflammatory bowel diseasePathogenesisNOD2InflammationImmunologyColitisMyeloidDiseaseMedicineBiologyCrohn's diseasePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Inflammatory bowel disease (IBD) involves interaction between host genetic factors and environmental triggers. CCDC88B maps within one IBD risk locus on human chromosome 11q13. Here we show that CCDC88B protein increases in the colon during intestinal injury, concomitant with an influx of CCDC88B+lymphoid and myeloid cells. Loss of Ccdc88b protects against DSS-induced colitis, with fewer pathological lesions and reduced intestinal inflammation in Ccdc88b-deficient mice. In a T cell transfer model of colitis, Ccdc88b mutant CD4+ T cells do not induce colitis in immunocompromised hosts. Expression of human CCDC88B RNA and protein is higher in IBD patient colons than in control colon tissue. In human CD14+ myeloid cells, CCDC88B is regulated by cis-acting variants. In a cohort of patients with Crohn’s disease, CCDC88B expression correlates positively with disease risk. These findings suggest that CCDC88B has a critical function in colon inflammation and the pathogenesis of IBD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,304
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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