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Enregistrement W2762367549 · doi:10.24870/cjb.2017-a161

Arginylation regulates adipose tissue development and function via modulating PPARγ expression

2017· article· en· W2762367549 sur OpenAlexvenueno aff
Archana Singh, Sougata Saha

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Biotechnology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePeroxisome Proliferator-Activated Receptors
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAdipose tissueFunction (biology)Cell biologyPeroxisome proliferator-activated receptorExpression (computer science)BiologyInternal medicineChemistryEndocrinologyMedicineReceptorGeneticsComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Arginylation, a poorly understood post translational modification mediated by ATE1 known to regulate protein activity and stability Unconditional deletion of Ate1 results in embryonic lethality and postnatal whole body deletion of Ate1 in mouse results in adipose tissue dysfunction i.e. loss of visceral fat, exhibit higher metabolic rate and resistant to diet induced obesity Adipose tissue dysregulation leads to various life threatening diseases like obesity, diabetes, cardiovascular defects and cancer Current study is undertaken to understand the role of protein arginylation in adipose tissue development and function. Our initial investigation showed an increase in ATE1 protein expression with progression of adipogenesis in 3t3L1 preadipocyte differentiation. Further, treatment of these cells with ATE1 inhibitors, tannic (10 M) acid and merbromin (75 M) suppressed lipid accumulation in 3t3l1 cell significantly. Gene expression analysis shows inhibition of peroxisome proliferator activated receptor gamma (PPAR) 1 and PPAR2 expression in 3t3l1 cells differentiated in presence of ATE1 inhibitors. PPAR is a key transcription factor of adipogenesis and plays crucial role in induction of various adipogenic genes which contributes to lipid formation. The mRNA level of PPAR associated genes glucose transporter 4 (GLUT4), fatty acid binding protein 4 (FABP4) and perilipin (pln1) were found to be downregulated by ATE1 inhibitors, hence results into decrease in lipid accumulation. As PPAR found to be a target for ATE1 inhibitors, PPAR1 was overexpressed in Ate1 knockout (KO1) and wild type mouse embryonic fibroblast (MEF) cells. Expression of PPAR1 was found to be significantly low in KO1 as compared to its wild type counterpart at transcript level. Interestingly inhibition of PPAR1 expression in absence of arginylation becomes more profound at protein level. Low level of PPAR1 impedes adipogenesis when KO1 cells were induced to differentiation with poor induction of GLUT4, lipoprotein lipase and FABP4. Current study provides a new protein arginylation dependent adipogenic pathway which promotes adipogenesis by promoting PPAR.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,087
Score d'incertitude au seuil0,451

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
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