MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2762482174 · doi:10.1016/j.yrtph.2017.10.007

Framework for the quality assurance of ’omics technologies considering GLP requirements

2017· review· en· W2762482174 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueRegulatory Toxicology and Pharmacology · 2017
Typereview
Langueen
DomaineVeterinary
ThématiqueAnimal testing and alternatives
Établissements canadiensHealth Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésQuality assuranceRaw dataTraceabilityOmicsComputer scienceContext (archaeology)Data qualitySoftwareQuality (philosophy)DocumentationRisk analysis (engineering)Data scienceEngineeringSoftware engineeringBioinformaticsMedicineBiologyOperations management

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

'Omics technologies are gaining importance to support regulatory toxicity studies. Prerequisites for performing 'omics studies considering GLP principles were discussed at the European Centre for Ecotoxicology and Toxicology of Chemicals (ECETOC) Workshop Applying 'omics technologies in Chemical Risk Assessment. A GLP environment comprises a standard operating procedure system, proper pre-planning and documentation, and inspections of independent quality assurance staff. To prevent uncontrolled data changes, the raw data obtained in the respective 'omics data recording systems have to be specifically defined. Further requirements include transparent and reproducible data processing steps, and safe data storage and archiving procedures. The software for data recording and processing should be validated, and data changes should be traceable or disabled. GLP-compliant quality assurance of 'omics technologies appears feasible for many GLP requirements. However, challenges include (i) defining, storing, and archiving the raw data; (ii) transparent descriptions of data processing steps; (iii) software validation; and (iv) ensuring complete reproducibility of final results with respect to raw data. Nevertheless, 'omics studies can be supported by quality measures (e.g., GLP principles) to ensure quality control, reproducibility and traceability of experiments. This enables regulators to use 'omics data in a fit-for-purpose context, which enhances their applicability for risk assessment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,985
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,562
Tête enseignante GPT0,570
Écart entre enseignants0,008 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle