MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W2762622819

CD44 modulates cofilin expression in human colon cancer cells

2006· article· en· W2762622819 sur OpenAlexaff
Venkateswaran Subramaniam, Isabella R. Vincent, Emily Chan, Serge Jothy

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCell Adhesion Molecules Research
Établissements canadiensUniversity of TorontoSt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCofilinCD44BiologyProtein kinase BCancer researchKnockout mouseApoptosisActin cytoskeletonCell biologyWestern blotMolecular biologyPhosphorylationCellCytoskeletonReceptorBiochemistry
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

3442 Colon cancer is among the leading causes of cancer death in North America. Dysregulation of the colonic crypt homeostasis is evident in the early stage of cancer. Moreover, cytoskeletal rearrangement of actin also plays a crucial role in morphological changes during neoplastic transformation events, including impairment of apoptosis. CD44, an adhesion and antiapoptotic molecule is overexpressed in colon cancer and is known to interact with certain cytoskeletal proteins. Cofilin is an actin binding protein and is involved with the directional motility of cells. In the present study, we asked whether the upregulation of CD44, has an effect of cofilin and proteins acting downstream from them. We used a human colon cancer cell line, HT29, which expresses both the standard and variant isoforms of CD44, HT29 where CD44 expression was inhibited by siRNA, and the colon from CD44 knockout and control mice. Western blot analysis of lysates from HT29 cells where CD44 levels were downregulated by siRNA, showed increased level of cofilin expression compared to vector control. The same set of lysates also had increased level of AKT phosphorylation. Immunocytochemistry showed that cofilin expression in colonic epithelial cells was greater in HT29 cells where CD44 was inhibited by siRNA, as compared to vector controls. Experiments using LY294002, an inhibitor of AKT phosphorylation, indicated that cofilin is stabilized by phosphorylated AKT. Knockout mice colon and colonic crypts isolated from them exhibit greater levels of active caspase 3, as compared to wild type mice. Western blot analysis of CD44 knock out mice colon lysates exhibited slightly lower levels of cofilin as compared to the colon lysates from wild type mice. This is in spite of having higher levels of AKT phosphorylation suggesting that other compensatory pathways operate in vivo. Cofilin expression is thus mechanistically associated with CD44 expression. AKT-phosphorylation and caspase 3 activation may have a key role in cofilin modulation. Given the well defined roles of CD44, phosphorylated AKT and caspase 3 in apoptosis and cancer, their role in modulating cofilin expression can cause alterations in the directional motility of tumor cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,073
Tête enseignante GPT0,443
Écart entre enseignants0,370 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCancer Research→Même sujetCell Adhesion Molecules Research→Travaux en français237 207→