Molecular alterations associated with chronic exposure to cigarette smoke and chewing tobacco in normal oral keratinocytes
Notice bibliographique
Résumé
Tobacco usage is a known risk factor associated with development of oral cancer. It is mainly consumed in two different forms (smoking and chewing) that vary in their composition and methods of intake. Despite being the leading cause of oral cancer, molecular alterations induced by tobacco are poorly understood. To investigate the adverse effects of cigarette smoke/chewing tobacco exposure in oral keratinocytes, we developed two cellular models where normal oral keratinocytes were chronically exposed to cigarette smoke and chewing tobacco for a period of 8 months. Cellular assays reveal that OKF6/TERT1 cells acquire an oncogenic phenotype after chronic exposure to cigarette smoke/chewing tobacco. We employed both whole exome sequencing (WES) and quantitative proteomics approaches to investigate the molecular alterations in oral keratinocytes (OKF6/TERT1) chronically exposed to smoke and chewing tobacco. Exome sequencing revealed a much higher rate of C>A transversions in smoke exposed cells in conjunction with previous studies. In contrast, C>G transversions were observed to be higher in chewing tobacco exposed cells. Diverse mutations in both treated cells further highlight the distinct effects of each exposure. Distinct proteomic alterations were observed in smoke and chewing tobacco exposed cells compared to parental cells. In addition, we observe enrichment of different signaling cascades in transformed oral cells upon chronic exposure to either cigarette smoke or chewing tobacco. Current analysis defines a clear distinction in the molecular dysregulation in oral cells in response to different tobacco-based insults. Future studies are needed to validate some of the genetic and proteomic alterations unique to each form of tobacco exposure. This study can serve as a reference for fundamental damage on oral cells as a consequence of exposure to different forms of tobacco.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».