Condensin II and GAIT complexes cooperate to restrict LINE-1 retrotransposition in epithelial cells
Notice bibliographique
Résumé
LINE-1 (L1) retrotransposons can mobilize (retrotranspose) within the human genome, and mutagenic de novo L1 insertions can lead to human diseases, including cancers.As a result, cells are actively engaged in preventing L1 retrotransposition.This work reveals that the human Condensin II complex restricts L1 retrotransposition in both non-transformed and transformed cell lines through inhibition of L1 transcription and translation.Condensin II subunits, CAP-D3 and CAP-H2, interact with members of the Gamma-Interferon Activated Inhibitor of Translation (GAIT) complex including the glutamyl-prolyl-tRNA synthetase (EPRS), the ribosomal protein L13a, Glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase (GAPDH), and NS1 associated protein 1 (NSAP1).GAIT has been shown to inhibit translation of mRNAs encoding inflammatory proteins in myeloid cells by preventing the binding of the translation initiation complex, in response to Interferon gamma (IFN-γ).Excitingly, our data show that Condensin II promotes complexation of GAIT subunits.Furthermore, RNA-Immunoprecipitation experiments in epithelial cells demonstrate that Condensin II and GAIT subunits associate with L1 RNA in a co-dependent manner, independent of IFN-γ.These findings suggest that cooperation between the Condensin II and GAIT complexes may facilitate a novel mechanism of L1 repression, thus contributing to the maintenance of genome stability in somatic cells. Author summaryLINE-1 (L1) retrotransposons mobilize within the human genome and L1 insertions are implicated in the development of various cancers.This work identifies the Condensin II complex as a novel repressor of L1 expression and retrotransposition in human primary and transformed epithelial cells.Proteomics analyses reveal interactions between Condensin II subunits, CAP-D3 and CAP-H2, and Gamma-Interferon Activated Inhibitor of
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».