Spent culture medium analysis from individually cultured bovine embryos demonstrates metabolomic differences
Notice bibliographique
Résumé
Spent culture medium can provide valuable information regarding the physiological state of a bovine preimplantation embryos through non-invasive analysis of the sum/depleted metabolite constituents. Metabolomics has become of great interest as an adjunct technique to morphological and cleavage-rate assessment, but more importantly, in improving our understanding of metabolism. In this study, in vitro produced bovine embryos developing at different rates were evaluated using proton nuclear magnetic resonance (1H NMR). Spent culture medium from individually cultured embryos (2-cell to blastocyst stage) were divided into two groups based on their cleavage rate fast growing (FG) and slow growing (SG; developmentally delayed by 12-24 h), then analyzed by a 600 MHz NMR spectrometer. Sixteen metabolites were detected and investigated for sum/depletion throughout development. Data indicate distinct differences between the 4-cell SG and FG embryos for pyruvate (P < 0.05, n = 9) and at the 16-cell stage for acetate, tryptophan, leucine/isoleucine, valine and histidine. Overall sum/depletion levels of metabolites demonstrated that embryos produced glutamate, but consumed histidine, tyrosine, glycine, methionine, tryptophan, phenylalanine, lysine, arginine, acetate, threonine, alanine, pyruvate, valine, isoleucine/leucine, and lactate with an overall trend of higher consumption of these metabolites by FG groups. Principal component analysis revealed distinct clustering of the plain medium, SG, and FG group, signifying the uniqueness of the metabolomic signatures of each of these groups. This study is the first of its kind to characterize the metabolomic profiles of SG and FG bovine embryos produced in vitro using 1H NMR. Elucidating differences between embryos of varying developmental rates could contribute to a better understanding of embryonic health and physiology.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».