Direct Disk Diffusion Susceptibility Testing for Staphylococcus aureus from Blood Cultures: Diagnostic Accuracy and Impact on Antimicrobial Stewardship
Notice bibliographique
Résumé
In order to detect multidrug resistant strains of bacteria, our laboratory routinely performs direct susceptibility (DS), in addition to standardized susceptibilities (SS), testing from positive blood cultures. We conducted a prospective study to determine the accuracy, reporting time (RT), and antimicrobial stewardship impact of DS testing for Staphylococcus aureus positive blood cultures. From March–December 2016, first time positive blood cultures for S. aureus were included. Broth from positive blood culture bottles was inoculated to standard media, as well as to Mueller–Hinton agar with a cefoxitin disk. CLSI breakpoints for S. aureus were used to guide interpretation. If DS results were to be reported to clinicians, a penicillin-binding protein 2a (PBP2a) Alere™ test was performed. When the PBP2a result was concordant with the CLSI interpretation, the isolate was reported as either Methicillin-susceptible S. aureus (MSSA) or Methicillin-resistant S. aureus (MRSA). Antibiotic therapy changes made based on reporting of DS results were recorded. In order to determine RT, the following time points were recorded: blood culture positivity, reading of DS, and reporting of SS Of the 100 patients with S. aureus bacteremia, 97 showed pure growth of MSSA or MRSA; 3 patients had mixed infections, all of which were only detected using the DS plates. Average RT was 23 hours and 36h for DS and SS, respectively. There were 32 MRSA isolates, with a cefoxitin zone size range of 6–15 mm (median = 8 mm). PBP2a was performed on 11 isolates; all were positive. Of the 69 MSSA isolates, the cefoxitin range was 22 to 32 mm (median = 27 mm). PBP2a was performed on 26 isolates; all were negative. Direct susceptibility results were reported on 31 patients. Of the 21 patients with MSSA bacteremia, 15 changed therapy from vancomycin/daptomycin to cloxacillin/cefazolin. These results were reported an average of 23 hours prior to SS. DS testing is an accurate and rapid method to determine whether isolates are MSSA or MRSA. We had no major or minor errors. PBP2a testing was concordant for all isolates tested. DS also has the added benefit of detecting mixed S. aureus infections. Clinicians acted on the reported results of DS testing, with 15/21 (71%) of our patients narrowed to a cloxacillin/cefazolin 23 hours before the availability of SS. All authors: No reported disclosures.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,014 | 0,069 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».