Characterisation of asthma subgroups associated with circulating YKL-40 levels
Notice bibliographique
Résumé
The chitinase-like protein YKL-40 mediates airway inflammation and serum levels are associated with asthma severity. However, asthma phenotypes associated with YKL-40 levels have not been precisely defined.We conducted an unsupervised cluster analysis of asthma patients treated at the Yale Center for Asthma and Airways Disease (n=156) to identify subgroups according to YKL-40 level. The resulting YKL-40 clusters were cross-validated in cohorts from the Severe Asthma Research Programme (n=167) and the New York University/Bellevue Asthma Repository (n=341). A sputum transcriptome analysis revealed molecular pathways associated with YKL-40 subgroups.Four YKL-40 clusters (C1-C4) were identified. C3 and C4 had high serum YKL-40 levels compared with C1 and C2. C3 was associated with earlier onset and longer duration of disease, severe airflow obstruction, and near-fatal asthma exacerbations. C4 had the highest serum YKL-40 levels, adult onset and less airflow obstruction, but frequent exacerbations. An airway transcriptome analysis in C3 and C4 showed activation of non-type 2 inflammatory pathways.Elevated serum YKL-40 levels were associated with two distinct clinical asthma phenotypes: one with irreversible airway obstruction and another with severe exacerbations. The YKL-40 clusters are potentially useful for identification of individuals with severe or exacerbation-prone asthma.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».