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Enregistrement W2763568382 · doi:10.24870/cjb.2017-a165

EMT factor Zeb1 depletion in dendritic cells enhances Helminth clearance in mice by increasing Th2 cell differentiation

2017· article· en· W2763568382 sur OpenAlexvenueno aff
Shuchi Smita, Sunil K. Raghav

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Biotechnology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueVector-Borne Animal Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCell biologyCellular differentiationChemistryDendritic cellCellCancer researchFactor (programming language)ImmunologyBiologyImmune systemBiochemistryComputer scienceGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Dendritic cells are professional antigen presenting cells that act as bridging link between innate and adaptive immune system. They are equipped with pathogen recognition receptors (PRR) to identify the pathogen associated molecular pattern (PAMPS) on any antigen. DCs elicit an immune response through polarizing T cells towards various subtypes like Th1, Th2 & Tregs. Though DC-T cell interaction has been widely studied, but how this single DC molecule amalgamate various transcriptional signals for translating the message to the T cells and induce diverse immunological responses still needs to be unraveled. Therefore to identify the role of transcription factor in immune programming we have targeted the largest member of TFs family, Zinc Finger Transcription Factors (ZF-TFs). Among various ZF-TFs we have narrowed our study to three interesting candidates Zeb1, Zeb2 and Zbtb10 based on their expression in DCs from an unpublished microarray data. Here in this study we have tried to understand the role of Zeb1, master regulator of EMT program in orchestrating DC responses. Zeb1 links the epithelial – mesenchymal transition and has been widely studied molecule in cancer biology. Except for the fact that it act as transcriptional repressor and represses IL2 gene promoter no other reports are available in immune biology, thereby rendering it a perfect candidate to be used for detailed characterization in dendritic cells. In our study, we found that Zeb1 depleted CD8α+DCs shows an increase in co-stimulatory marker like CD80 & CD86 whereas there is a decrease in MHC class I & II molecule. Thereafter at transcript & protein level we found decrease in pro-inflammatory & anti-inflammatory cytokine like IL6 & IL10 respectively, the bioactive form of IL12 i.e. IL12p70 which polarizes T cells towards Th1 response showed a significant decrease in bio-plex when compared with control CD8α+DCs. The regulatory markers which develop regulatory T cells like Pdl1, IL27 also showed decreasing trend in zeb1 depleted DCs. Thereafter we speculated that these Zeb1 perturbed DCs might be involved in default Th2 program. So, we looked into T-cell polarization by co-culture & MLR experiments which showed an increase in GATA3+ T cells, a signature transcription factor for Th2 subtype along with higher levels of IL4, IL5 and IL13 Th2 cytokines. To evaluate the in-vivo function of Zeb1 knockdown (KD) cells we developed Helminth Polygyrus (H.Poly) disease model in mice, there we assessed for the worm load in intestine and egg count in the feces which showed a marked decrease in worm count and egg count in Zeb1 KD adoptive transfer mice as compared to control mice. The T cell response was examined through the draining lymph node (mesenteric lymph node) where we found significant increase in GATA3+ T cells along with IL5 and IL13; this suggested that Zeb1 KD DCs polarize the T cells towards Th2 response which results in clearance of H. polygyrus in mice.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,650
Score d'incertitude au seuil0,976

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,203
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
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