MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W2763576963 · doi:10.1093/pch/19.6.e35-38

39: Five Years of Cystic Fibrosis Newborn Screening: Our Experience

2014· article· en· W2763576963 sur OpenAlexaffabout
E. Fleischer, Stephanie Ho, April Price

Notice bibliographique

RevuePaediatrics & Child Health · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeonatal Respiratory Health Research
Établissements canadiensLondon Health Sciences Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCystic fibrosisSweat testMedicineGold standard (test)Newborn screeningPopulationGenetic testingPercentilePediatricsSWEATInternal medicineMutationGeneticsEnvironmental healthBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In the spring of 2008, Newborn Screening Ontario (NSO) expanded their panel to include cystic fibrosis (CF), using an immunoreactive trypsinogen (IRT)/DNA protocol. Those that are positive are referred for a sweat test, which is still considered the gold standard for diagnosis. The goal is to detect a population at risk for CF and upon diagnosis, initiate therapy, minimizing adverse outcomes. We have chosen to perform confirmatory molecular testing on each screen-positive individual, differing from some other centres in Ontario, because our hospital laboratory uses a larger mutation panel (70+6 polymorphisms) compared to that used by NSO (39 +3 polymorphisms). This aligns with the provincial recommendations set out by NSO as part of the diagnostic work up. To examine whether confirmatory molecular testing using our expanded panel on all screen-positive newborns is justified. We performed a retrospective descriptive analysis of the results of our program recorded from April 2008 to 2013 using an internal database. Particular note was made of individuals found to have a second mutation with our confirmatory panel, and of the sweat chloride obtained. 337 patients have screened positive and been referred to our centre for sweat chloride testing. Of these, 25 (7.4%) have been referred with two mutations identified and 258 (76.5%) have one known mutation found. In addition, 47 (13.9%) have no known mutations, but are offered a sweat chloride as their IRT level exceeds the 99th percentile. Using our expanded panel, we uncovered a second mutation in 14 children, eight of whom would have been discharged as unaffected as they had normal initial sweat tests. Thirteen infants had a sweat chloride that fell within the ‘borderline’ range of 30 mmol/L to 60 mmol/L, of whom seven infants had two known mutations already identified by NSO, four infants had an additional mutation identified on our panel, and two infants required sequencing to identify a second mutation. To our knowledge, since the inception of this program, there have been no children with classical CF that were not identified on newborn screen. Though our approach may identify otherwise ‘healthy’ infants with a second mutation of unknown clinical relevance, given the uncertainty of the long-term prognosis associated with some mutations, we feel it continues to be warranted until more information is known.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,031
Score d'incertitude au seuil0,062

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,359
Écart entre enseignants0,326 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePaediatrics & Child Health→Même sujetNeonatal Respiratory Health Research→Travaux en français237 207→