MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2763915478 · doi:10.1111/mec.14393

Genomics and telemetry suggest a role for migration harshness in determining overwintering habitat choice, but not gene flow, in anadromous Arctic Char

2017· article· en· W2763915478 sur OpenAlexafffundabout
Jean‐Sébastien Moore, Les N. Harris, Jérémy Le Luyer, Ben Sutherland, Quentin Rougemont, Ross F. Tallman, Aaron T. Fisk, Louis Bernatchez

Notice bibliographique

RevueMolecular Ecology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and phenotypic traits in livestock
Établissements canadiensUniversity of WindsorFisheries and Oceans CanadaUniversité Laval
Organismes subventionnairesNatural Resources CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaFonds Québécois de la Recherche sur la Nature et les TechnologiesW. Garfield Weston Foundation
Mots-clésArctic charBiologyOverwinteringGene flowFish migrationEcologyHabitatArcticCharTelemetryEvolutionary biologyGeneGeneticsFisherySalvelinusGenetic variation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Migration is a ubiquitous life history trait with profound evolutionary and ecological consequences. Recent developments in telemetry and genomics, when combined, can bring significant insights on the migratory ecology of nonmodel organisms in the wild. Here, we used this integrative approach to document dispersal, gene flow and potential for local adaptation in anadromous Arctic Char from six rivers in the Canadian Arctic. Acoustic telemetry data from 124 tracked individuals indicated asymmetric dispersal, with a large proportion of fish (72%) tagged in three different rivers migrating up the same short river in the fall. Population genomics data from 6,136 SNP markers revealed weak, albeit significant, population differentiation (average pairwise F ST = 0.011) and asymmetric dispersal was also revealed by population assignments. Approximate Bayesian computation simulations suggested the presence of asymmetric gene flow, although in the opposite direction to that observed from the telemetry data, suggesting that dispersal does not necessarily lead to gene flow. These observations suggested that Arctic Char home to their natal river to spawn, but may overwinter in rivers with the shortest migratory route to minimize the costs of migration in nonbreeding years. Genome scans and genetic–environment associations identified 90 outlier markers putatively under selection, 23 of which were in or near a gene. Of these, at least four were involved in muscle and cardiac function, consistent with the hypothesis that migratory harshness could drive local adaptation. Our study illustrates the power of integrating genomics and telemetry to study migrations in nonmodel organisms in logistically challenging environments such as the Arctic.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,615
Score d'incertitude au seuil0,915

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations77
Publié2017
Routes d'admission3
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMolecular EcologyMême sujetGenetic and phenotypic traits in livestockTravaux en français237 207