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Enregistrement W2764341089 · doi:10.1080/15548627.2017.1382782

Conserved and unique features of the fission yeast core Atg1 complex

2017· article· en· W2764341089 sur OpenAlexafffund
Tamiza Nanji, Xu Liu, Leon H. Chew, Franco K.K. Li, M. Biswas, Zhong-Qiu Yu, Shan Lu, Meng-Qiu Dong, Li‐Lin Du, Daniel J. Klionsky, Calvin K. Yip

Notice bibliographique

RevueAutophagy · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthNational Institute of General Medical SciencesGovernment of Canada
Mots-clésSchizosaccharomyces pombeBiologySaccharomyces cerevisiaeProtein subunitCell biologySchizosaccharomycesYeastBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Although the human ULK complex mediates phagophore initiation similar to the budding yeast Saccharomyces cerevisiae Atg1 complex, this complex contains ATG101 but not Atg29 and Atg31. Here, we analyzed the fission yeast Schizosaccharomyces pombe Atg1 complex, which has a subunit composition that resembles the human ULK complex. Our pairwise coprecipitation experiments showed that while the interactions between Atg1, Atg13, and Atg17 are conserved, Atg101 does not bind Atg17. Instead, Atg101 interacts with the HORMA domain of Atg13 and this enhances the stability of both proteins. We also found that S. pombe Atg17, the putative scaffold subunit, adopts a rod-shaped structure with no discernible curvature. Interestingly, S. pombe Atg17 binds S. cerevisiae Atg13, Atg29, and Atg31 in vitro, but it cannot complement the function of S. cerevisiae Atg17 in vivo. Furthermore, S. pombe Atg101 cannot substitute for the function of S. cerevisiae Atg29 and Atg31 in vivo. Collectively, our work generates new insights into the subunit organization and structural properties of an Atg101-containing Atg1/ULK complex.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,599
Score d'incertitude au seuil0,170

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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