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Enregistrement W2765156844 · doi:10.3389/fimmu.2017.01397

LC3-Associated Phagocytosis Is Required for Dendritic Cell Inflammatory Cytokine Response to Gut Commensal Yeast Saccharomyces cerevisiae

2017· article· en· W2765156844 sur OpenAlexaff
Dimitra Lamprinaki, Gemma Beasy, Aleksandra Zhekova, Alexandra Wittmann, Steve A. James, Jo Dicks, Yoichiro Iwakura, Shinobu Saijo, Xiaomin Wang, Chung‐Wai Chow, Ian N. Roberts, Tamás Korcsmáros, Ulríke Mayer, Thomas Wileman, Norihito Kawasaki

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Immunology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueGalectins and Cancer Biology
Établissements canadiensUniversity Health NetworkUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesFP7 People: Marie-Curie ActionsBiotechnology and Biological Sciences Research Council
Mots-clésBiologyMicrobiologySykImmune systemMycobiotaPattern recognition receptorC-type lectinCandida albicansSaccharomyces cerevisiaeGut floraCell biologyYeastInnate immune systemImmunologyTyrosine kinaseSignal transductionBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The human fungal microbiota known as mycobiota is increasingly recognized as a critical factor in human gut health and disease. Nonpathogenic commensal yeasts such as Saccharomyces cerevisiae promote homeostasis in the gut, whereas dysbiosis of the gut mycobiota is associated with inflammation. Glycan-binding receptors (lectins) are key host factors in host-mycobiota interaction in the gut. They are expressed on immune cells such as dendritic cells (DCs) and recognize fungal polysaccharides. This interaction is imperative to mount appropriate immune responses for immune homeostasis in the gut as well as clearance of fungal pathogens. Recent studies demonstrate that microtubule-associated protein light-chain 3 (LC3)-associated phagocytosis (LAP) is involved in lectin-fungi interactions. Yet the biological impact of LAP on the lectin function remains largely elusive. In this report, we demonstrate that in mouse LAP is linked to Dectin-2, a C-type lectin specific to fungal -mannan polysaccharide. We found that mouse Dectin-2 recognizes commensal yeast S. cerevisiae and Kazachstania unispora. Mouse bone marrow-derived DCs (BMDCs) produced inflammatory cytokines TNF and IL-1 in response to the yeasts in a Dectin-2 and Syk dependent manner. We found S. cerevisiae and K. unispora induced LAP in mouse BMDCs upon internalization. Furthermore, LC3 was activated by stimulation of BMDCs with the yeasts in a Dectin-2 and Syk-dependent manner. To address the biological impact of LAP on Dectin-2-yeast interaction, we established a knock-in mouse strain (Atg16L1E230, thereafter called E230), which BMDCs exhibit autophagy-active and LAP-negative phenotypes. When stimulated with yeasts, E230 BMDCs produced significantly less amounts of TNF and IL-1. Taken together, we revealed a novel link between Dectin-2 and LAP that enables host immune cells to respond to mycobiota.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,601
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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