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Enregistrement W2765240614 · doi:10.1002/ajmg.b.32606

OPTN p.Met468Arg and ATXN2 intermediate length polyQ extension in families with C9orf72 mediated amyotrophic lateral sclerosis and frontotemporal dementia

2017· article· en· W2765240614 sur OpenAlexafffund
Sali M.K. Farhan, Tania F. Gendron, Leonard Petrucelli, Robert A. Hegele, Michael J. Strong

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Medical Genetics Part B Neuropsychiatric Genetics · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAmyotrophic Lateral Sclerosis Research
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésC9orf72Amyotrophic lateral sclerosisFrontotemporal dementiaTrinucleotide repeat expansionPhenotypeGeneticsBiologyDiseaseGeneDementiaMedicinePathologyAllele

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We have ascertained two families affected with familial amyotrophic lateral sclerosis (ALS) in which they both carry a hexanucleotide repeat expansion in the C9orf72 gene, specifically in individuals who also presented with frontotemporal dementia (FTD) or behavioral variant FTD (bvFTD). While some reports attribute this phenotypic heterogeneity to the C9orf72 expansion alone, we screened for additional genetic variation in known ALS-FTD genes that may also contribute to or modify the phenotypes. We performed genetic testing consisting of C9orf72 hexanucleotide expansion, ATXN2 polyglutamine (polyQ) expansion, and targeted next generation sequencing using the ONDRISeq, a gene panel consisting of 80 genes known to be associated with neurodegenerative diseases such as ALS, FTD, Alzheimer's disease, Parkinson's disease, and vascular cognitive impairment. In addition to the C9orf72 expansion, we observed an ATXN2 polyQ intermediate length expansion, and OPTN p.Met468Arg in patients who exhibited ALS and FTD or bvFTD. We conclude that the C9orf72 expansion likely explains much of the ALS-FTD phenotype; however, inheritance of these additional variants likely modifies the disease course and may provide further evidence for biologically relevant oligogenic inheritance in ALS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,291
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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