MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2765328067 · doi:10.1002/lom3.10218

Analyzing the shape of observed trait distributions enables a data‐based moment closure of aggregate models

2017· article· en· W2765328067 sur OpenAlexfundno aff
Ursula Gaedke, Toni Klauschies

Notice bibliographique

RevueLimnology and Oceanography Methods · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEvolution and Genetic Dynamics
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesDeutsche ForschungsgemeinschaftMcGill University
Mots-clésKurtosisTraitSkewnessVariance (accounting)Moment (physics)MathematicsStatisticsMoment closureEconometricsAggregate (composite)Normal distributionStatistical physicsComputer scienceEconomicsPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The shape of trait distributions may inform about the selective forces that structure ecological communities. Here, we present a new moment‐based approach to classify the shape of observed biomass‐weighted trait distributions into normal, peaked, skewed, or bimodal that facilitates spatio‐temporal and cross‐system comparisons. Our observed phytoplankton trait distributions exhibited substantial variance and were mostly skewed or bimodal rather than normal. Additionally, mean, variance, skewness und kurtosis were strongly correlated. This is in conflict with trait‐based aggregate models that often assume normally distributed trait values and small variances. Given these discrepancies between our data and general model assumptions we used the observed trait distributions to test how well different aggregate models with first‐ or second‐order approximations and different types of moment closure predict the biomass, mean trait, and trait variance dynamics using weakly or moderately nonlinear fitness functions. For weakly non‐linear fitness functions aggregate models with a second‐order approximation and a data‐based moment closure that relied on the observed correlations between skewness and mean, and kurtosis and variance predicted biomass and often also mean trait changes fairly well and better than models with first‐order approximations or a normal‐based moment closure. In contrast, none of the models reflected the changes of the trait variances reliably. Aggregate model performance was often also poor for moderately nonlinear fitness functions. This questions a general applicability of the normal‐based approach, in particular for predicting variance dynamics determining the speed of trait changes and maintenance of biodiversity. We evaluate in detail how and why better approximations can be obtained.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,017
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,017
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,078
Tête enseignante GPT0,354
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueLimnology and Oceanography MethodsMême sujetEvolution and Genetic DynamicsTravaux en français237 207