Structural investigation by tandem mass spectrometry analysis of a heterogeneous mixture of Lipid A <sub>n</sub> isolated from the lipopolysaccharide of <i>Aeromonas hydrophila</i> SJ‐55Ra
Notice bibliographique
Résumé
Rationale We report herein the electrospray ionization mass spectrometry (ESI‐MS) negative ion mode and low‐energy collision‐induced dissociation tandem mass spectrometry (CID‐MS/MS) analysis of a mixture of lipid A n isolated from the lipopolysaccharide (LPS) of a rough‐resistant wild strain of the Gram‐negative bacteria Aeromonas hydrophila grown in the presence of phages (SJ‐55Ra). This investigation indicates that the presence of a mixture of lipid A acylated disaccharides, whose molecular structures were not relatively conserved, resulted from the incomplete LPS biosynthesis caused by the phage treatment. Methods The heterogeneous lipid A n mixture from the LPS‐SJ55Ra was obtained following growth of the Gram‐negative bacteria Aeromonas hydrophila (SJ‐55R) in the presence of phages and isolation by the aqueous phenol method. Following hydrolysis and purification of the lipopolysaccharide, ESI‐MS and low‐energy CID‐MS/MS analyses were performed on a triple‐quadrupole (QqQ) and a Fourier transform ion cyclotron resonance (FTICR) instrument. Results ESI‐MS analysis suggested that this lipid A n mixture contained eight molecular disaccharide anions and three monosaccharide anions. This series of lipid A n was asymmetrically substituted with ((R)‐14:0(3‐OH)) fatty acids located at O‐3 and N‐2 and with branched fatty acids: (Cl4:0(3‐(R)‐ O ‐C14:0)) and (C12:0(3‐(R)‐ O ‐(14:0)) at the O‐3′ and N‐2′ positions. Conclusions Tandem mass spectrometric analyses allowed the exact determination of the fatty acid acylation locations on the D‐Glc p N disaccharide. The MS/MS results established that it was possible to selectively cleave C–O, C–N, and C–C bonds, together with glycosidic C–O and cross‐ring cleavages, affording excellent structural analysis of lipid A biomolecules.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».