Effects of Amerindian Genetic Ancestry on Clinical Variables and Therapy in Patients with Rheumatoid Arthritis
Notice bibliographique
Résumé
Objective. To define whether Amerindian genetic ancestry correlates with clinical and therapeutic variables in admixed individuals with rheumatoid arthritis (RA) from Latin America. Methods. Patients with RA (n = 1347) and healthy controls (n = 1012) from Argentina, Mexico, Chile, and Peru were included. Samples were genotyped for the Immunochip v1 using the Illumina platform. Clinical data were obtained through interviews or the clinical history. Results. Percentage of Amerindian ancestry was comparable between cases and controls. Morning stiffness (p < 0.0001, OR 0.05), rheumatoid factor (RF; p < 0.0001, OR 0.22), radiographic changes (p < 0.0001, OR 0.05), and higher number of criteria were associated with lower Amerindian ancestry after Bonferroni correction. Higher Amerindian ancestry correlated only with weight loss (pBonferroni < 0.0001, OR 2.85). Increased Amerindian ancestry correlated with higher doses of azathioprine (p < 0.0001, OR 163.6) and sulfasalazine (p < 0.0001, OR 48.6), and inversely with methotrexate (p = 0.001, OR 0.35), leflunomide (p = 0.001, OR 0.16), and nonsteroidal antiinflammatory drugs (pBonferroni = 0.001, OR 0.37). Only the presence of RF and weight loss were modified after confounders adjustment. Conclusion. Amerindian ancestry protects against most major clinical criteria of RA, but regarding the association of RF with increased European ancestry, age, sex, and smoking are modifiers. Ancestry also correlates with the therapeutic profiles.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».