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Enregistrement W2765919764 · doi:10.1016/j.jalz.2017.06.1407

[P3–195]: PROFILING EXOSOMAL MIRNAS IN EARLY ONSET ALZHEIMER's DISEASE CEREBROSPINAL FLUID

2017· article· en· W2765919764 sur OpenAlexaff
Paul M. McKeever, Raphaël Schneider, Namita Multani, Foad Taghdiri, Robert A. Brown, Adam L. Boxer, Janice Robertson, Maria Carmela Tartaglia

Notice bibliographique

RevueAlzheimer s & Dementia · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueExtracellular vesicles in disease
Établissements canadiensMcGill UniversityUniversity Health NetworkUniversity of TorontoMontreal Neurological Institute and HospitalOccupational Cancer Research Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésmicroRNAMicrovesiclesBiologyExosomeCerebrospinal fluidEarly-onset Alzheimer's diseaseDiseaseMicroarrayGeneticsBioinformaticsMedicineDementiaGeneInternal medicineGene expressionNeuroscience

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Early onset Alzheimer's disease (EOAD) occurs before the age of 65 and represents 5–10% of all AD cases. EOAD and late onset AD share amyloid and tau pathology but there are important differences between the two with respect to age of onset, speed of progression and presenting symptoms. Since EOAD is only rarely caused by autosomal dominant mutation inheritance, there are currently no distinguishing biomarkers for EOAD alone. MicroRNAs (miRNAs) are short non-coding RNAs involved in the degradation or translational repression of several mRNA targets. MiRNAs are packaged into exosomes, released by cells into the extracellular milieu and biofluids, including cerebrospinal fluid (CSF), and are implicated in cell-to-cell communication. We hypothesized that uncovering significantly altered exosomal miRNAs in the CSF of EOAD patients would reveal novel biomarkers, provide insight into disease mechanism, and guide therapeutic development. CSF was obtained by lumbar puncture from patients diagnosed with EOAD (n=17, 60.88±4.62 years) and healthy controls (n=12; 67.08±7.83 years). The miRCURYExosome Isolation Kit (Exiqon) was used to isolate exosomes from 1.0mL of input CSF. Subsequently, the miRNA was purified from each exosomal prep and converted into cDNA. For the discovery phase of the study, each sample underwent real-time PCR on two 384 well plates with 752 miRNA primer sets (Exiqon Human Panels I and II), whereby candidate differentially expressed miRNAs were revealed. For the validation phase, candidate miRNAs are being confirmed by independent real-time PCR experiments. Preliminary data from the discovery phase revealed that of 52 miRNAs expressed in at least 75% of all samples, 7 were up-regulated and 10 were down-regulated in the exosomal CSF from EOAD compared with healthy controls (all p<0.05). To date, the down-regulation of miR-451a in EOAD has been validated (p<0.01). Computational modeling is being performed to assess whether multiple differentially expressed miRNAs can predict EOAD diagnosis. Also, a bioinformatics analysis is being conducted to identify putative mRNA targets and pathways altered in EOAD. This study identified novel differentially expressed exosomal miRNAs from CSF isolated from EOAD patients. These miRNAs may differentiate EOAD from other forms of AD, elucidate disease mechanism, and contribute novel targets for therapeutics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission1
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