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Enregistrement W2766035972 · doi:10.1016/j.jalz.2017.12.004

<i>CDK5RAP2</i> gene and tau pathophysiology in late‐onset sporadic Alzheimer's disease

2018· article· en· W2766035972 sur OpenAlexafffundabout
Justin Miron, Cynthia Picard, Nathalie Nilsson, Josée Frappier, Doris Dea, Louise Théroux

Notice bibliographique

RevueAlzheimer s & Dementia · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensMcGill UniversityDouglas Mental Health University Institute
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of California, San DiegoGenentechNational Institutes of HealthIXICOServierInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleKing's College LondonKing Faisal Specialist Hospital and Research CentreBundesministerium für Bildung und ForschungNational Institute on AgingNational Institute for Health and Care ResearchNorthern California Institute for Research and EducationAgence Nationale de la RechercheWellcome TrustUniversity of Southern CaliforniaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaPfizerBioClinicaBiogenAlzheimer SocietyEisaiDevelopment of Innovative Strategies for a Transdisciplinary approach to ALZheimer's diseaseU.S. Department of DefenseEli Lilly and CompanyBristol-Myers SquibbCentre hospitalier régional universitaire de LilleH. Lundbeck A/SAlzheimer’s Research UKMedical Research CouncilMeso Scale DiagnosticsAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeNational Heart, Lung, and Blood InstituteNovartis Pharmaceuticals CorporationWellcomeAlzheimer's Association
Mots-clésDiseaseSingle-nucleotide polymorphismBiologyGenetic associationGeneticsGeneAlzheimer's diseaseAlleleGenome-wide association studyGenetic variationPopulationMedicineGenotypeInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Because currently known Alzheimer's disease (AD) single-nucleotide polymorphisms only account for a small fraction of the genetic variance in this disease, there is a need to identify new variants associated with AD. METHODS: Our team performed a genome-wide association study in the Quebec Founder Population isolate to identify novel protective or risk genetic factors for late-onset sporadic AD and examined the impact of these variants on gene expression and AD pathology. RESULTS: The rs10984186 variant is associated with an increased risk of developing AD and with a higher CDK5RAP2 mRNA prevalence in the hippocampus. On the other hand, the rs4837766 variant, which is among the best cis-expression quantitative trait loci in the CDK5RAP2 gene, is associated with lower mild cognitive impairment/AD risk and conversion rate. DISCUSSION: The rs10984186 risk and rs4837766 protective polymorphic variants of the CDK5RAP2 gene might act as potent genetic modifiers for AD risk and/or conversion by modulating the expression of this gene.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,075
Score d'incertitude au seuil0,150

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2018
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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