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Enregistrement W2766037448 · doi:10.1038/s41598-017-14930-8

Secretoneurin A regulates neurogenic and inflammatory transcriptional networks in goldfish (Carassius auratus) radial glia

2017· article· en· W2766037448 sur OpenAlexafffund
Dillon F. Da Fonte, Christopher J. Martyniuk, Lei Xing, Adrian Pelin, Nicolas Corradi, Wei Hu, Vance L. Trudeau

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurogenesis and neuroplasticity mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of Ottawa
Mots-clésTranscriptomeBiologyNeurogenesisNeuroscienceCell biologyDe novo transcriptome assemblyNeurogliaGene expressionGeneCentral nervous systemGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Radial glial cells (RGCs) are the most abundant macroglia in the teleost brain and have established roles in neurogenesis and neurosteroidogenesis; however, their transcriptome remains uncharacterized, which limits functional understanding of this important cell type. Using cultured goldfish RGCs, RNA sequencing and de novo transcriptome assembly were performed, generating the first reference transcriptome for fish RGCs with 17,620 unique genes identified. These data revealed that RGCs express a diverse repertoire of receptors and signaling molecules, suggesting that RGCs may respond to and synthesize an array of hormones, peptides, cytokines, and growth factors. Building upon neuroanatomical data and studies investigating direct neuronal regulation of RGC physiology, differential gene expression analysis was conducted to identify transcriptional networks that are responsive to the conserved secretogranin II-derived neuropeptide secretoneurin A (SNa). Pathway analysis of the transcriptome indicated that cellular processes related to the central nervous system (e.g., neurogenesis, synaptic plasticity, glial cell development) and immune functions (e.g., immune system activation, leukocyte function, macrophage response) were preferentially modulated by SNa. These data reveal an array of new functions that are proposed to be critical to neuronal-glial interactions through the mediator SNa.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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