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Enregistrement W2766084854 · doi:10.3747/co.24.3595

Clinical Utility of Multigene Profiling Assays in Early-Stage Breast Cancer

2017· article· en· W2766084854 sur OpenAlexaffvenueabout
Martin C. Chang, Lesley Souter, Suzanne Kamel‐Reid, Michael Rutherford, Philippe L. Bédard, Maureen Trudeau, Jennifer Hart, Andrea Eisen

Notice bibliographique

RevueCurrent Oncology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBreast Cancer Treatment Studies
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreHealth Sciences NorthUniversity Health NetworkCancer Care OntarioMcMaster UniversityJuravinski HospitalOccupational Cancer Research CentreMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineOncologyBreast cancerGuidelineMEDLINEInternal medicineClinical PracticeTamoxifenBioinformaticsGynecologyFamily medicineCancerPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: This clinical practice guideline was developed to determine the level of evidence supporting the clinical utility of commercially available multigene profiling assays and to provide guidance about whether certain breast cancer patient populations in Ontario would benefit from alternative tests in addition to Oncotype dx (Genomic Health, Redwood City, CA, U.S.A.). METHODS: A systematic electronic Ovid search of the medline and embase databases sought out systematic reviews and primary literature. A systematic review and practice guideline was written by a working group and was then reviewed and approved by Cancer Care Ontario's Molecular Oncology Advisory Committee. RESULTS: Twenty-four studies assessing the clinical utility of Oncotype dx, Prosigna (NanoString Technologies, Seattle, WA, U.S.A.), EndoPredict (Myriad Genetics, Salt Lake City, U.S.A.), and MammaPrint (Agendia, Irvine, CA, U.S.A.) were included in the evidence base. CONCLUSIONS: The clinical utility of multigene profiling assays is currently established for an appropriate subset of patients with estrogen receptor-positive, her2-negative, node-negative breast cancer for whom a decision to give chemotherapy is difficult to make. For patients with estrogen receptor-positive tumours who receive tamoxifen alone, Oncotype dx, Prosigna, and EndoPredict validly identify a low-risk population with favourable outcomes, indicating that a low-risk assay result is actionable and the decision to withhold chemotherapy is supported. Clinical evidence indicates that a high Oncotype dx recurrence score can predict for chemotherapy benefit, but a high Prosigna or EndoPredict score, although prognostic, is not, based on clinical trial evidence, directly actionable. Prosigna and EndoPredict are statistically more likely to identify a population at risk for recurrence beyond 5 years, but that information is currently not actionable because of a lack of interventional studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,050
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,140
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,050
Score d'incertitude au seuil0,263

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0500,140
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,006
Bibliométrie0,0090,006
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0040,003
Science ouverte0,0040,002
Intégrité de la recherche0,0050,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,153
Tête enseignante GPT0,477
Écart entre enseignants0,324 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2017
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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