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Enregistrement W2766115525 · doi:10.1159/000481401

Gut Microbiome in Inflammatory Bowel Disease and Other Chronic Immune-Mediated Inflammatory Diseases

2017· review· en· W2766115525 sur OpenAlexaff
Çharles N. Bernstein, Jessica D. Forbes

Notice bibliographique

RevueInflammatory Intestinal Diseases · 2017
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensCanadian Science Centre for Human and Animal HealthUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMicrobiomeInflammatory bowel diseaseImmunologyDysbiosisImmune systemUlcerative colitisGut floraDiseaseMedicineBiologyBioinformaticsInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Since the description of the normal human gut microbiome in healthy individuals using broad-range polymerase chain reaction, there has been great advancement in the techniques used to conduct microbiome research and applications of this research across health, gastrointestinal diseases, and nongastrointestinal diseases. SUMMARY AND KEY MESSAGES: In inflammatory bowel disease (IBD), studies have reported gut dysbiosis meaning that the microbial composition, diversity, and richness are altered. Persons with IBD harbor on average 25% fewer microbial genes than healthy persons. Reduced diversity has been reported in both the fecal and mucosal microbiome of IBD. Crohn disease and ulcerative colitis are systemic diseases with immunological alterations in both intestinal and circulating compartments. As knowledge about the impact of the gut microbiome on the intestinal and systemic immune response has grown, researchers have begun exploring how the gut microbiome may impact on other systemic conditions. Considering the role of microbes especially on regulatory T cells, it was plausible that the gut microbiome may have a role in other chronic immune-mediated inflammatory diseases. In this review, studies of the gut microbiome in other chronic immune-mediated inflammatory diseases are discussed including how the information can inform our understanding of the gut microbiome in IBD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,291 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations87
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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