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Enregistrement W2766188345 · doi:10.1002/lno.10734

Viruses on the menu: The appendicularian<i>Oikopleura dioica</i>efficiently removes viruses from seawater

2017· article· en· W2766188345 sur OpenAlexafffund
Janice Lawrence, Joachim Töpper, Elżbieta Petelenz‐Kurdziel, Gunnar Bratbak, Aud Larsen, Eric M. Thompson, Christofer Troedsson, Jessica Louise Ray

Notice bibliographique

RevueLimnology and Oceanography · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueBacteriophages and microbial interactions
Établissements canadiensUniversity of New Brunswick
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNorges Forskningsråd
Mots-clésBiologyClearance rateMicrobial loopPlanktonMarine bacteriophagePhytoplanktonBacteriaEcologyNutrient

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Appendicularians are planktonic marine tunicates with elaborate filter‐feeding houses that can efficiently trap particles as small as 0.2 μm. While marine viruses are seldom considered outside their role in disease transmission, we conducted a controlled laboratory experiment to determine if the appendicularian Oikopleura dioica can trap and ingest the Emiliania huxleyi virus (EhV; 160–180 nm diameter). Removal and retention of EhV during 2.5 h and overnight incubations at 15°C were measured using flow cytometry and quantitative polymerase chain reaction specific for the mcp gene of EhV. The fate of retained EhV was tested by quantifying EhV DNA in three biological compartments: house‐trapping, ingestion/digestion, and defecation. Clearance rates for EhV varied from approximately 2 mL ind −1 d −1 to 50 mL ind −1 d −1 , with highest rates for 4–5 d‐old animals. EhV particles were cleared by O. dioica at rates similar to those reported for larger food particles, with mean clearance rates in the 2.5 h incubations ranging from approximately 2 mL ind −1 d −1 to 50 mL ind −1 d −1 . This demonstrates efficient virus removal by O. dioica and a previously overlooked link between the microbial loop and the classical marine food web. EhV DNA was readily detectable above background levels in O. dioica houses, gut contents, and faecal pellets, suggesting that appendicularian houses and faecal pellets may contribute to the dispersal of viruses. Furthermore, clearance of EhV and presumably other viruses by O. dioica may be a significant sink for viruses and thus an important factor in regulating the population dynamics of viruses and their hosts.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesÉtudes des sciences et des technologies, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,445
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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