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Enregistrement W2766190792 · doi:10.2174/2211550104666150414185950

Purification and Molecular Characterization of an [FeFe]-Hydrogenase from <i>Thermotoga hypogea</i>

2015· article· en· W2766190792 sur OpenAlexaff
Xianqin Yang, Liangliang Hao, Hongbin Zhu, Kesen Ma

Notice bibliographique

RevueCurrent Biotechnology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineEnergy
ThématiqueMetalloenzymes and iron-sulfur proteins
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHydrogenaseFerredoxinEnzymeChemistryProtein subunitThermotoga maritimaSulfurStereochemistryBiochemistryGeneEscherichia coliOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Thermotoga hypogea is a hyperthermophilic bacterium growing on carbohydrates and peptides, producing acetate, CO2 and H2 as major end products. Hydrogenase activity was detected in the cell-free extract of T. hypogea and a hydrogenase was purified to homogeneity. The purified enzyme was homotetrameric with a subunit of 65 kDa, and contained 16 atoms of Fe and 11.6 atoms of acid labile sulfur per mole subunit. The gene encoding the hydrogenase was sequenced, and four iron-sulfur clusters including the H-cluster were found to be present in the gene sequence, indicating it is an [FeFe]-hydrogenase. The enzyme was oxygen sensitive with a t1/2 of 3 min when exposed to air. It was thermostable with t1/2 values of approximately 40 and 15 min when incubated at 70°C and 85°C, respectively. The optimal temperature for the hydrogenase activity was about 85 °C. Both benzyl viologen (BV) and methyl viologen (MV) could serve as electron acceptors, and the apparent Vmax values were determined to be 1,142 and 607 μmol H2 oxidized min-1 mg-1, respectively. For H2 uptake activity, the apparent Km values for MV and BV were 0.17 and 0.24 mM, respectively. For H2 evolution activity, the apparent Km value for MV and apparent Vmax value were determined to be 1.1 mM and 192 μmol min-1 mg-1, respectively. Ferredoxin purified from T. hypogea served as electron carrier. The enzyme exhibited pH optima of 10.0 and 8.0 for the H2 uptake and evolution activities, respectively. The physiological function of the enzyme is proposed to catalyze the H2 evolution. Keywords: [FeFe]-hydrogenase, ferredoxin, iron-sulfur clusters, ferredoxin, hydrogen production, hyperthermophiles, Thermotoga hypogea.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,164
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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