Purification and Molecular Characterization of an [FeFe]-Hydrogenase from <i>Thermotoga hypogea</i>
Notice bibliographique
Résumé
Thermotoga hypogea is a hyperthermophilic bacterium growing on carbohydrates and peptides, producing acetate, CO2 and H2 as major end products. Hydrogenase activity was detected in the cell-free extract of T. hypogea and a hydrogenase was purified to homogeneity. The purified enzyme was homotetrameric with a subunit of 65 kDa, and contained 16 atoms of Fe and 11.6 atoms of acid labile sulfur per mole subunit. The gene encoding the hydrogenase was sequenced, and four iron-sulfur clusters including the H-cluster were found to be present in the gene sequence, indicating it is an [FeFe]-hydrogenase. The enzyme was oxygen sensitive with a t1/2 of 3 min when exposed to air. It was thermostable with t1/2 values of approximately 40 and 15 min when incubated at 70°C and 85°C, respectively. The optimal temperature for the hydrogenase activity was about 85 °C. Both benzyl viologen (BV) and methyl viologen (MV) could serve as electron acceptors, and the apparent Vmax values were determined to be 1,142 and 607 μmol H2 oxidized min-1 mg-1, respectively. For H2 uptake activity, the apparent Km values for MV and BV were 0.17 and 0.24 mM, respectively. For H2 evolution activity, the apparent Km value for MV and apparent Vmax value were determined to be 1.1 mM and 192 μmol min-1 mg-1, respectively. Ferredoxin purified from T. hypogea served as electron carrier. The enzyme exhibited pH optima of 10.0 and 8.0 for the H2 uptake and evolution activities, respectively. The physiological function of the enzyme is proposed to catalyze the H2 evolution. Keywords: [FeFe]-hydrogenase, ferredoxin, iron-sulfur clusters, ferredoxin, hydrogen production, hyperthermophiles, Thermotoga hypogea.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».