Wavelet Imaging on Multiple Scales (WIMS) reveals focal adhesion distributions, dynamics and coupling between actomyosin bundle stability
Notice bibliographique
Résumé
We introduce and use Wavelet Imaging on Multiple Scales (WIMS) as an improvement to fluorescence correlation spectroscopy to measure physical processes and features that occur across multiple length scales. In this study, wavelet transforms of cell images are used to characterize molecular dynamics at the cellular and subcellular levels (i.e. focal adhesions). We show the usefulness of the technique by applying WIMS to an image time series of a migrating osteosarcoma cell expressing fluorescently labelled adhesion proteins, which allows us to characterize different components of the cell ranging from optical resolution scale through to focal adhesion and whole cell size scales. Using WIMS we measured focal adhesion numbers, orientation and cell boundary velocities for retraction and protrusion. We also determine the internal dynamics of individual focal adhesions undergoing assembly, disassembly or elongation. Thus confirming as previously shown, WIMS reveals that the number of adhesions and the area of the protruding region of the cell are strongly correlated, establishing a correlation between protrusion size and adhesion dynamics. We also apply this technique to characterize the behavior of adhesions, actin and myosin in Chinese hamster ovary cells expressing a mutant form of myosin IIB (1935D) that displays decreased filament stability and impairs front-back cell polarity. We find separate populations of actin and myosin at each adhesion pole for both the mutant and wild type form. However, we find these populations move rapidly inwards toward one another in the mutant case in contrast to the cells that express wild type myosin IIB where those populations remain stationary. Results obtained with these two systems demonstrate how WIMS has the potential to reveal novel correlations between chosen parameters that belong to different scales.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».