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Enregistrement W2766278473 · doi:10.1111/2041-210x.12931

Growing the biphasic framework: Techniques and recommendations for fitting emerging growth models

2017· article· en· W2766278473 sur OpenAlexafffund
Kyle L. Wilson, Andrew E. Honsey, Brian J. Moe, Paul Venturelli

Notice bibliographique

RevueMethods in Ecology and Evolution · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueFish Ecology and Management Studies
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesKillam Trusts
Mots-clésMarkov chain Monte CarloComputer scienceTraitInferenceBayesian probabilityEconometricsBayesian inferenceMachine learningArtificial intelligenceMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Several new growth models have been proposed to account for the life‐history trade‐offs that occur when indeterminately growing species allocate energy between somatic growth and reproduction. These models can improve the understanding of lifetime growth and life history, but can be more difficult to fit than conventional growth models. Increased data demands, multiple growth phases and increased parameterization all serve as barriers to the adoption and proper use of these new models. We review and comment on confounding issues during model fitting for several of these models, and provide advice on surmounting such issues. We then simulation‐test an example model, the Lester biphasic growth model, using several common fitting approaches. We highlight the biases and precision of each approach and provide guiding documents using r and jags code. The Bayesian Markov chain Monte Carlo and likelihood profiling approaches generally provided the best fits. Simpler approaches can be unbiased and precise if sampled data are of relatively high quality (e.g. moderate sample sizes for juvenile and adult phases) and model assumptions are met. Bayesian hierarchical approaches can accommodate more complicated data scenarios (e.g. unbalanced design across multiple populations); we provide an example of such an approach by recovering growth trajectories and inferring growth‐associated trait variation and environmental effects across multiple populations. Conventional growth models provide limited inference on life history. Many biphasic growth models can provide direct inference on multiple life‐history traits, but can be difficult to fit. The recommended approaches herein provide a path forward for fitting biphasic growth models in a variety of scenarios, allowing for wider application and tests of life history and ecological theory.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesÉtudes des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,360
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0020,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,375
Écart entre enseignants0,332 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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