Association between donor and recipient Interleukin-18 gene polymorphisms and the risk of infection after liver transplantation
Notice bibliographique
Résumé
PURPOSE: The purpose of this study was to retrospectively evaluate the association between Interleukin-18 (IL-18) gene polymorphisms of the donor and recipient in liver transplant patients with bacterial infections. METHODS: Five single nucleotide polymorphisms (SNPs) (rs7106524, rs5744247, rs1946518, rs549908 and rs187238) of the IL-18 gene from the donors were genotyped and their association with post-operative bacterial infections was evaluated in liver transplant patients (N=113). A second independent group of liver transplant patients from a different organ transplant centre was also recruited for validation purposes (N=44). RESULTS: IL-18 mRNA mean expression levels and protein levels were significantly lower in liver transplant patients with bacterial infections. For the donor SNP rs1946518, more recipients carried the A allele in the bacterial-infected group than the uninfected group (61.4% vs 39.7%; P ≤0.002). The mean IL-18 mRNA expression and protein levels were significantly lower in the transplanted livers of recipients carrying the rs1946518 AA genotype compared with those from recipients with CC genotype (3.64, 3.33 vs. 2.75, P≤0.048). The A allele of rs1946518 also resulted in lower luciferase activity than the C allele in a reporter assay. The area under ROC curve indicated that the rs1946518 SNP genotype in the donor liver predicted an increased risk of bacterial infection after liver transplantation (AUROC>0.82). CONCLUSIONS: These findings indicate that the IL-18 rs1946518 SNP in the donor liver is a risk factor for developing bacterial infection after liver transplantation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».