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Enregistrement W2766418371 · doi:10.25011/cim.v40i5.28623

Association between donor and recipient Interleukin-18 gene polymorphisms and the risk of infection after liver transplantation

2017· article· en· W2766418371 sur OpenAlexvenueno aff
Baojie Shi, Xiaoyu Yu, Hao Li, Junwei Fan, Pei‐Wen Wang, Zhihai Peng, Lin Zhong

Notice bibliographique

RevueClinical and investigative medicine · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammasome and immune disorders
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismGenotypeLiver transplantationAlleleSNPInternal medicineGastroenterologyTransplantationBiologyImmunologyMedicineGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: The purpose of this study was to retrospectively evaluate the association between Interleukin-18 (IL-18) gene polymorphisms of the donor and recipient in liver transplant patients with bacterial infections. METHODS: Five single nucleotide polymorphisms (SNPs) (rs7106524, rs5744247, rs1946518, rs549908 and rs187238) of the IL-18 gene from the donors were genotyped and their association with post-operative bacterial infections was evaluated in liver transplant patients (N=113). A second independent group of liver transplant patients from a different organ transplant centre was also recruited for validation purposes (N=44). RESULTS: IL-18 mRNA mean expression levels and protein levels were significantly lower in liver transplant patients with bacterial infections. For the donor SNP rs1946518, more recipients carried the A allele in the bacterial-infected group than the uninfected group (61.4% vs 39.7%; P ≤0.002). The mean IL-18 mRNA expression and protein levels were significantly lower in the transplanted livers of recipients carrying the rs1946518 AA genotype compared with those from recipients with CC genotype (3.64, 3.33 vs. 2.75, P≤0.048). The A allele of rs1946518 also resulted in lower luciferase activity than the C allele in a reporter assay. The area under ROC curve indicated that the rs1946518 SNP genotype in the donor liver predicted an increased risk of bacterial infection after liver transplantation (AUROC>0.82). CONCLUSIONS: These findings indicate that the IL-18 rs1946518 SNP in the donor liver is a risk factor for developing bacterial infection after liver transplantation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,298
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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