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Enregistrement W2766450105 · doi:10.1074/mcp.ra117.000124

Novel Sarcopenia-related Alterations in Sarcomeric Protein Post-translational Modifications (PTMs) in Skeletal Muscles Identified by Top-down Proteomics

2017· article· en· W2766450105 sur OpenAlexaff
Liming Wei, Zachery R. Gregorich, Ziqing Lin, Wenxuan Cai, Yutong Jin, Susan H. McKiernan, Sean J. McIlwain, Judd M. Aiken, Richard L. Moss, Gary M. Diffee, Ying Ge

Notice bibliographique

RevueMolecular & Cellular Proteomics · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMuscle metabolism and nutrition
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institute on AgingNational Institutes of Health
Mots-clésSarcopeniaProteomicsPosttranslational modificationSkeletal muscleComputational biologyBioinformaticsCell biologyChemistryMedicineBiologyInternal medicineBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sarcopenia, the age-related loss of skeletal muscle mass and strength, is a significant cause of morbidity in the elderly and is a major burden on health care systems. Unfortunately, the underlying molecular mechanisms in sarcopenia remain poorly understood. Herein, we utilized top-down proteomics to elucidate sarcopenia-related changes in the fast- and slow-twitch skeletal muscles of aging rats with a focus on the sarcomeric proteome, which includes both myofilament and Z-disc proteins-the proteins that constitute the contractile apparatuses. Top-down quantitative proteomics identified significant changes in the post-translational modifications (PTMs) of critical myofilament proteins in the fast-twitch skeletal muscles of aging rats, in accordance with the vulnerability of fast-twitch muscles to sarcopenia. Surprisingly, age-related alterations in the phosphorylation of Cypher isoforms, proteins that localize to the Z-discs in striated muscles, were also noted in the fast-twitch skeletal muscle of aging rats. This represents the first report of changes in the phosphorylation of Z-disc proteins in skeletal muscle during aging. In addition, increased glutathionylation of slow skeletal troponin I, a novel modification that may help protect against oxidative damage, was observed in slow-twitch skeletal muscles. Furthermore, we have identified and characterized novel muscle type-specific proteoforms of myofilament proteins and Z-disc proteins, including a novel isoform of the Z-disc protein Enigma. The finding that the phosphorylation of Z-disc proteins is altered in response to aging in the fast-twitch skeletal muscles of aging rats opens new avenues for the investigation of the role of Z-discs in age-related muscle dysfunction.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,037
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations48
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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