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Enregistrement W2766622315 · doi:10.1681/asn.2017030267

Genome-Wide Meta-Analysis Unravels Interactions between Magnesium Homeostasis and Metabolic Phenotypes

2017· review· en· W2766622315 sur OpenAlexaff
Tanguy Corre, Francisco J. Arjona, Caroline Hayward, Sonia Youhanna, Jeroen H. F. de Baaij, Hendrica Belge, Nadine Nägele, Huguette Debaix, Maxime G. Blanchard, Michela Traglia, Sarah E. Harris, Sheila Ulivi, Rico Rueedi, David Lamparter, Aurélien Macé, Cinzia Sala, Stefania Lenarduzzi, Belén Ponte, Menno Pruijm, Daniel Ackermann, Georg Ehret, Daniela Baptista, Ozren Polašek, Igor Rudan, Toby W. Hurd, Nicholas D. Hastie, Véronique Vitart, Gérard Waeber, Zoltán Kutalik, Sven Bergmann, Rosa Vargas‐Poussou, Martin Konrad, Paolo Gasparini, Ian J. Deary, John M. Starr, Daniela Toniolo, Péter Vollenweider, Joost G.J. Hoenderop, René J.M. Bindels, Murielle Bochud, Olivier Devuyst

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Society of Nephrology · 2017
Typereview
Langueen
DomaineNursing
ThématiqueMagnesium in Health and Disease
Établissements canadiensInstitute of Population and Public Health
Organismes subventionnairesSwiss National Centre of Competence in Research Kidney Control of HomeostasisBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilEuropean Renal Association-European Dialysis and Transplant AssociationMedical Research CouncilFondation LeenaardsEuropean CommissionNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekSystemsX.chGlaxoSmithKlineSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungNational Science Foundation
Mots-clésHomeostasisBiologyPopulationEndocrinologyInsulin resistanceGlucose homeostasisInternal medicineGenome-wide association studyGeneGeneticsInsulinSingle-nucleotide polymorphismMedicineGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Magnesium (Mg 2+ ) homeostasis is critical for metabolism. However, the genetic determinants of the renal handling of Mg 2+ , which is crucial for Mg 2+ homeostasis, and the potential influence on metabolic traits in the general population are unknown. We obtained plasma and urine parameters from 9099 individuals from seven cohorts, and conducted a genome-wide meta-analysis of Mg 2+ homeostasis. We identified two loci associated with urinary magnesium (uMg), rs3824347 ( P= 4.4×10 −13 ) near TRPM6 , which encodes an epithelial Mg 2+ channel, and rs35929 ( P= 2.1×10 −11 ), a variant of ARL15 , which encodes a GTP-binding protein. Together, these loci account for 2.3% of the variation in 24-hour uMg excretion. In human kidney cells, ARL15 regulated TRPM6-mediated currents. In zebrafish, dietary Mg 2+ regulated the expression of the highly conserved ARL15 ortholog arl15b , and arl15b knockdown resulted in renal Mg 2+ wasting and metabolic disturbances. Finally, ARL15 rs35929 modified the association of uMg with fasting insulin and fat mass in a general population. In conclusion, this combined observational and experimental approach uncovered a gene–environment interaction linking Mg 2+ deficiency to insulin resistance and obesity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,008
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens large)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,997
Score d'incertitude au seuil0,025

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,008
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,009
Bibliométrie0,0020,004
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,135
Tête enseignante GPT0,400
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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