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Enregistrement W2766645990 · doi:10.1002/lom3.10221

Open the Sterivex<sup>TM</sup> casing: An easy and effective way to improve DNA extraction yields

2017· article· en· W2766645990 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueLimnology and Oceanography Methods · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Community Ecology and Physiology
Établissements canadiensUniversity of VictoriaInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de QuébecUniversité Laval
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCartridgeExtraction (chemistry)CasingDNA extractionDNAProtocol (science)Filter (signal processing)ChromatographyComputer scienceBiological systemMaterials scienceComputational biologyChemistryBiologyEngineeringPolymerase chain reactionBiochemistryGeneMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract We describe an inexpensive, reliable, and easily executed improvement for the extraction of DNA from Sterivex TM filter units, that involves the separation of the Sterivex TM filter from its casing. Our study demonstrates that our modification of the original extraction protocol significantly increased DNA yields, with an average increase of 4.1‐fold more DNA than with the standard approach. A comparison of the diversity after Illumina MiSeq sequencing of bacterial communities extracted with both the standard approach and the proposed one indicated that our modified protocol has no or little impact on the results. This protocol provides a relatively straight forward means to achieve higher yields of DNA from the extraction of Sterivex TM cartridges without altering the community composition and will likely be of interest to a wide range of scientists that use techniques based on the recovery of DNA from filters.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesÉtudes des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,783
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,358
Écart entre enseignants0,329 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle