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Enregistrement W2766746819 · doi:10.1371/journal.pone.0187712

Fibrinogen and clot-related phenotypes determined by fibrinogen polymorphisms: Independent and IL-6-interactive associations

2017· article· en· W2766746819 sur OpenAlexfundno aff
Héléne T. Cronjé, Cornelie Nienaber‐Rousseau, Lizelle Zandberg, Zelda de Lange, Fiona R. Green, Marlien Pieters

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBlood properties and coagulation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNorth-West UniversityAcademy of Medical SciencesMcMaster UniversityMedical Research CouncilSouth African Medical Research CouncilNational Research FoundationHamilton Health Sciences
Mots-clésFibrinogenPhenotypeGeneticsAfibrinogenemiaMedicineBiologyBioinformaticsInternal medicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Interleukin-6 (IL-6) induces the expression of fibrinogen, and polymorphic variation within the fibrinogen genes is believed to alter the magnitude of this expression. The identification of the functional relevance of individual fibrinogen single nucleotide polymorphisms (SNPs) has been hindered by the high linkage disequilibrium (LD) reported in the European fibrinogen gene locus. This study investigated two novel and 12 known fibrinogen SNPs of potential functional relevance, in 2010 Tswana individuals known to have low LD. We aimed to identify functional polymorphisms that contribute to clot-related phenotypes and total and γ' fibrinogen concentrations independently and through their interaction with IL-6, by taking advantage of the high fibrinogen and IL-6 concentrations and the low LD reported in black South Africans. Fibrinogen was significantly associated with IL-6, thereby mediating associations of IL-6 with clot formation and structure, although attenuating the association of IL-6 with clot lysis time. None of the common European fibrinogen haplotypes was present in this study population. Putative functional fibrinogen SNPs FGB-rs7439150, rs1800789 (-1420G/A) and rs1800787 (-148C/T) were significantly associated with fibrinogen concentration and altered clot properties, with several associations significantly influenced by IL-6 concentrations. The impact of harbouring several minor fibrinogen SNP alleles on the association of IL-6 and fibrinogen concentration was cumulative, with possession of each additional minor allele showing a stronger relationship of IL-6 with fibrinogen. This was also reflected in differences in clot properties, suggesting potential clinical relevance. Therefore, when investigating the effect of fibrinogen genetics on fibrinogen concentrations and CVD outcome, the possible interactions with modulating factors and the fact that SNP effects seem to be additive should be taken into account.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,426
Score d'incertitude au seuil0,474

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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