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Enregistrement W2766815401 · doi:10.1183/13993003.01034-2017

A simple algorithm for the identification of clinical COPD phenotypes

2017· article· en· W2766815401 sur OpenAlexaff
Jean-Louis Paillasseur, Wim Janssens, J. Piquet, Gerben ter Riet, Judith García‐Aymerich, Borja G. Cosío, Per Bakke, Milo A. Puhan, Arnulf Langhammer, Inmaculada Alfageme, Pere Almagro, Julio Ancochea, Bartolomé R. Celli, Ciro Casanova, Juan P. de‐Torres, Marc Decramer, Andrés L. Echazarreta, Cristóbal Esteban, Rosa Mar Gómez Punter, MeiLan K. Han, Ane Johannessen, Bernhard Kaiser, Bernd Lamprecht, Peter Lange, Linda Leivseth, José M. Marı́n, Francis Martin, Pablo Martínez‐Camblor, Marc Miravitlles, Toru Oga, Ana Sofia Ramírez, Don D. Sin, Patricia Sobradillo, Juan José Soler‐Cataluña, Alice Turner, Javier Verdú, Joan B. Soriano, Nicolás Roche

Notice bibliographique

RevueEuropean Respiratory Journal · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChronic Obstructive Pulmonary Disease (COPD) Research
Établissements canadiensSt. Paul's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesBoehringer Ingelheim
Mots-clésMedicineSimple (philosophy)Identification (biology)COPDAlgorithmPhenotypeClinical phenotypeInternal medicineGeneticsComputer scienceGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This study aimed to identify simple rules for allocating chronic obstructive pulmonary disease (COPD) patients to clinical phenotypes identified by cluster analyses. Data from 2409 COPD patients of French/Belgian COPD cohorts were analysed using cluster analysis resulting in the identification of subgroups, for which clinical relevance was determined by comparing 3-year all-cause mortality. Classification and regression trees (CARTs) were used to develop an algorithm for allocating patients to these subgroups. This algorithm was tested in 3651 patients from the COPD Cohorts Collaborative International Assessment (3CIA) initiative. Cluster analysis identified five subgroups of COPD patients with different clinical characteristics (especially regarding severity of respiratory disease and the presence of cardiovascular comorbidities and diabetes). The CART-based algorithm indicated that the variables relevant for patient grouping differed markedly between patients with isolated respiratory disease (FEV 1 , dyspnoea grade) and those with multi-morbidity (dyspnoea grade, age, FEV 1 and body mass index). Application of this algorithm to the 3CIA cohorts confirmed that it identified subgroups of patients with different clinical characteristics, mortality rates (median, from 4% to 27%) and age at death (median, from 68 to 76 years). A simple algorithm, integrating respiratory characteristics and comorbidities, allowed the identification of clinically relevant COPD phenotypes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,949
Score d'incertitude au seuil0,647

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,093
Tête enseignante GPT0,408
Écart entre enseignants0,316 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations68
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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