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Enregistrement W2766863101 · doi:10.1371/journal.pone.0187248

Pofut1 point-mutations that disrupt O-fucosyltransferase activity destabilize the protein and abolish Notch1 signaling during mouse somitogenesis

2017· article· en· W2766863101 sur OpenAlexfundno aff
Rieko Ajima, Emiko Suzuki, Yumiko Saga

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDevelopmental Biology and Gene Regulation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsResearch Organization of Information and Systems
Mots-clésNotch signaling pathwayBiologyCell biologySomitogenesisMutantHes3 signaling axisNotch proteinsSignal transductionGeneticsGeneSomiteEmbryoEmbryogenesis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The segmental pattern of the vertebrate body is established via the periodic formation of somites from the presomitic mesoderm (PSM). This periodical process is controlled by the cyclic and synchronized activation of Notch signaling in the PSM. Protein O-fucosyltransferase1 (Pofut1), which transfers O-fucose to the EGF domains of the Notch1 receptor, is indispensable for Notch signaling activation. The Drosophila homologue Ofut1 was reported to control Notch localization via two different mechanisms, working as a chaperone for Notch or as a regulator of Notch endocytosis. However, these were found to be independent of O-fucosyltransferase activity because the phenotypes were rescued by Ofut1 mutants lacking O-fucosyltransferase activity. Pofut1 may also be involved in the Notch receptor localization in mice. However, the contribution of enzymatic activity of Pofut1 to the Notch receptor dynamics remains to be elucidated. In order to clarify the importance of the O-fucosyltransferase activity of Pofut1 for Notch signaling activation and the protein localization in the PSM, we established mice carrying point mutations at the 245th a.a. or 370-372th a.a., highly conserved amino-acid sequences whose mutations disrupt the O-fucosyltransferase activity of both Drosophila Ofut1 and mammalian Pofut1, with the CRISPR/Cas9 mediated genome-engineering technique. Both mutants displayed the same severely perturbed somite formation and Notch1 subcellular localization defects as the Pofut1 null mutants. In the mutants, Pofut1 protein, but not RNA, became undetectable by E9.5. Furthermore, both wild-type and mutant Pofut1 proteins were degraded through lysosome dependent machinery. Pofut1 protein loss in the point mutant embryos caused the same phenotypes as those observed in Pofut1 null embryos.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,133
Score d'incertitude au seuil0,593

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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