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Enregistrement W2766896724 · doi:10.1097/ypg.0000000000000183

Multiple tissue methylation analysis of HTR2A exon I in suicidal behavior

2017· article· en· W2766896724 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevuePsychiatric Genetics · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensUniversity of TorontoCentre for Addiction and Mental Health
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of Toronto
Mots-clésEpigeneticsDNA methylationCpG siteMethylationExonBiologyGeneticsGeneGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: The main aim of the current study was to investigate epigenetic alterations in serotonin 2A receptor (HTR2A) exon I CpG sites as possible risk factors for suicidal behavior. We also aimed to analyze the epigenetic alterations in two different tissues as epigenetic mechanisms are tissue specific. These epigenetic changes may lead to a better prediction of suicidal behavior. METHODS: Direct CpG methylation analysis was carried out on genomic DNA from the saliva of 20 schizophrenia suicide attempters and 27 non-attempters, and from post-mortem brain tissues of nine suicide victims and 11 controls. We used bisulfite pyrosequencing to assess the contributions of six CpG sites including the rs6313 (C102T) site in the first exon of HTR2A in suicide attempters and suicide victims. RESULTS: DNA methylation analysis did not find a significant difference in CpG methylation between suicide attempters and non-attempters (P=0.759) or between suicide victims and controls (P=0.189). We found a strong positive correlation between CpG methylation levels in blood and saliva (r=0.547, P<0.001). DISCUSSION: DNA methylation analysis confirmed that the overall methylation level of HTR2A exon I was around 80% for DNA extracted from saliva and almost 30% in the frontal cortex DNA. The results of this investigation do not support the evidence that methylation analysis of the HTR2A may be useful for investigating the epigenetic factors involved in suicidal behavior.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,083
Score d'incertitude au seuil0,652

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,324
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle