Multiple tissue methylation analysis of HTR2A exon I in suicidal behavior
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: The main aim of the current study was to investigate epigenetic alterations in serotonin 2A receptor (HTR2A) exon I CpG sites as possible risk factors for suicidal behavior. We also aimed to analyze the epigenetic alterations in two different tissues as epigenetic mechanisms are tissue specific. These epigenetic changes may lead to a better prediction of suicidal behavior. METHODS: Direct CpG methylation analysis was carried out on genomic DNA from the saliva of 20 schizophrenia suicide attempters and 27 non-attempters, and from post-mortem brain tissues of nine suicide victims and 11 controls. We used bisulfite pyrosequencing to assess the contributions of six CpG sites including the rs6313 (C102T) site in the first exon of HTR2A in suicide attempters and suicide victims. RESULTS: DNA methylation analysis did not find a significant difference in CpG methylation between suicide attempters and non-attempters (P=0.759) or between suicide victims and controls (P=0.189). We found a strong positive correlation between CpG methylation levels in blood and saliva (r=0.547, P<0.001). DISCUSSION: DNA methylation analysis confirmed that the overall methylation level of HTR2A exon I was around 80% for DNA extracted from saliva and almost 30% in the frontal cortex DNA. The results of this investigation do not support the evidence that methylation analysis of the HTR2A may be useful for investigating the epigenetic factors involved in suicidal behavior.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».