A BACH2 Gene Variant Is Associated with Postoperative Recurrence of Crohn's Disease
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Crohn's disease often requires intestinal resection, which is not considered curative. Repeat surgical intervention is necessary in more than half of patients after their initial operation. Although many genetic loci are implicated in Crohn's disease, few have been associated with post-resection recurrence. STUDY DESIGN: A cohort of patients with Crohn's disease who underwent intestinal resection was analyzed to determine genetic and clinical factors associated with post-resection recurrence. Genotype was assessed at 8 loci associated with adaptive immunity (SMAD3, IL10RB, IL15RA, BACH2, IL12B, IL18RAP, IFNGR2, and JAK2). Univariate and multivariable survival analyses were performed using a log-rank test and Cox-proportional hazard model, respectively. RESULTS: One hundred and ninety-one patients with Crohn's disease and 11.2 years mean postoperative follow-up were included. Forty-six percent experienced a surgical recurrence. Factors associated with increased incidence of recurrence included male sex (p = 0.05) and shortened time to first intestinal operation (5.0 vs 7.3 years; p = 0.03); inflammatory disease behavior was associated with a lower chance of repeat operation (p < 0.01). Of the loci assessed on multivariable analysis, homozygosity for a risk allele at BACH2 (rs1847472) was significantly associated with disease recurrence (hazard ratio 1.54; 95% CI 1.00 to 2.36; p < 0.05). CONCLUSIONS: We identify BACH2 as a susceptibility locus for postoperative recurrence of Crohn's disease in our cohort. BACH2 is critical in the differentiation and function of T cells, as a regulator of B-cell activity, and is associated with several dysregulated immunologic phenomena. Its identification as a risk locus in postoperative Crohn's disease recurrence suggests a potential role for regulatory T cells, effector T cells, humoral immunity, and immunologic memory in the development of this disease process.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».