Evaluation of the diversity of garden potato varieties grown in Canada using simple sequence repeat and morphology
Notice bibliographique
Résumé
Garden potato varieties grown on more than 1.5 ha are subject to variety registration to be sold as seed potato in Canada. Prerequisites for the registration of varieties include the pedigree and breeding history as well as a morphological description. For most varieties, no pedigree or morphological description is available, and furthermore, some groups are essentially derived from one another. Therefore, a review to determine the genetic and morphological similarities and uniqueness of some of the garden potato varieties was initiated. Seven garden potato varieties grown over the largest areas in Canada were genotyped using a set of nine microsatellite [simple sequence repeat (SSR)] markers, resulting in six distinct SSR profiles. These varieties were also grown out for morphological description, providing supplementary information for the national registration and their monitoring during the seed certification process. To further assess the genetic similarities of garden or heritage varieties, 84 potato varieties were genotyped, and the unique SSR profiles of 62 varieties and six SSR profiles shared among the other 22 varieties were added to the Canadian Food Inspection Agency potato variety reference SSR profile collection. Furthermore, a set of blue varieties were described morphologically to evaluate the nature of morphological characteristic variation of varieties sharing the same SSR profile. Although all 14 varieties grown show some morphological differences, all varieties within each group sharing an SSR profile also clustered together based on morphological characteristics.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».