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Enregistrement W2767211704 · doi:10.1002/rcm.8024

Improving negative liquid chromatography/electrospray ionization mass spectrometry lipidomic analysis of human plasma using acetic acid as a mobile‐phase additive

2017· article· en· W2767211704 sur OpenAlexafffund
Cian Monnin, Parsram Ramrup, Carolann Daigle‐Young, Dajana Vuckovic

Notice bibliographique

RevueRapid Communications in Mass Spectrometry · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensConcordia University
Organismes subventionnairesPfizer CanadaMerck CanadaFondation Brain CanadaOntario Brain InstitutePfizer
Mots-clésChemistryChromatographyAcetic acidElectrospray ionizationAmmonium acetateLipidomicsMass spectrometryExtractive electrospray ionizationAmmonium hydroxideLiquid chromatography–mass spectrometrySelected reaction monitoringTriple quadrupole mass spectrometerTandem mass spectrometryHigh-performance liquid chromatographySample preparation in mass spectrometryBiochemistryOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

RATIONALE: Mobile-phase additives in liquid chromatography/mass spectrometry (LC/MS) are used to improve peak shape, analyte ionization efficiency and method coverage. Both basic and acidic mobile phases have been used successfully for negative electrospray ionization (ESI), but very few systematic investigations exist to date to justify the choice of mobile phase. Acetic acid was previously shown to improve ionization in untargeted metabolomics of urine, but has not been investigated in lipidomics. The goal of this study was to systematically compare the performance of acetic acid to that of other commonly employed additives in negative LC/ESI-MS lipidomics. METHODS: The performance of acetic acid was compared to that of commonly used mobile-phase additives in lipidomics, namely ammonium acetate, ammonium acetate with acetic acid and ammonium hydroxide, using lipid standard solutions containing representatives of major mammalian lipid subclasses and isopropanol-precipitated human plasma. This design allowed comparison of the influence of additive and additive concentration on lipid signal intensity, lipid peak shape and lipid coverage in both simple and complex biological matrices using both Orbitrap and quadrupole time-of-flight MS platforms with different ESI source designs. RESULTS: Ammonium hydroxide caused 2- to 1000-fold signal suppression of all lipid classes in comparison to acetic acid. In comparison to ammonium acetate, acetic acid increased lipid signal intensity from 2- to 19-fold for 11 lipid subclasses, and decreased ionization efficiency only for ceramide and phosphatidylcholine lipid classes which can be effectively ionized in positive ESI mode. The improved ionization efficiency using acetic acid also increased lipid coverage by 21-50% versus ammonium acetate additive. CONCLUSIONS: Acetic acid at a concentration of 0.02% (v/v) is the suggested choice as a mobile-phase additive for lipidomics and targeted lipid profiling with negative LC/ESI-MS based on signal enhancement and improved lipid coverage compared to ammonium acetate, ammonium acetate with acetic acid and ammonium hydroxide mobile phases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,033
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,003
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,318
Écart entre enseignants0,300 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations46
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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