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Enregistrement W2767287135 · doi:10.1016/s2214-109x(17)30392-3

Identification and management of Shigella infection in children with diarrhoea: a systematic review and meta-analysis

2017· review· en· W2767287135 sur OpenAlexaff
Kirkby D. Tickell, Rebecca L Brander, Hannah E Atlas, Jeffrey M. Pernica, Judd L. Walson, Patricia B. Pavlinac

Notice bibliographique

RevueThe Lancet Global Health · 2017
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCenter for AIDS Research, University of WashingtonUniversity of WashingtonBill and Melinda Gates Foundation
Mots-clésShigellaDysenteryMedicineShigellosisMeta-analysisShigella dysenteriaeDiarrheaShigella sonneiPediatricsAntibioticsIntensive care medicineInternal medicineMicrobiologySalmonellaBiologyPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background Shigella infections are a leading cause of diarrhoeal death among children in low-income and middle-income countries. WHO guidelines reserve antibiotics for treating children with dysentery. Reliance on dysentery for identification and management of Shigella infection might miss an opportunity to reduce Shigella -associated morbidity and mortality. We aimed to systematically review and evaluate Shigella -associated and dysentery-associated mortality, the diagnostic value of dysentery for the identification of Shigella infection, and the efficacy of antibiotics for children with Shigella or dysentery, or both. Methods We did three systematic reviews (for mortality, diagnostic value, and antibiotic treatment of Shigella and dysentery), and meta-analyses where appropriate, of studies in resource-limited settings. We searched MEDLINE, Embase, and LILACS database for studies published before Jan 1, 2017, in English, French, and Spanish. We included studies of human beings with diarrhoea and accepted all study-specific definitions of dysentery. For the mortality and diagnostic value searches, we excluded studies that did not include an effect estimate or data necessary to calculate this estimate. The search for treatment included only randomised controlled trials that were done after Jan 1, 1980, and assessed antibiotics in children (aged <18 years) with dysentery or laboratory-confirmed Shigella . We extracted or calculated odds ratios (ORs) and 95% CIs for relative mortality and did random-effects meta-analysis to arrive at pooled ORs. We calculated 95% CIs assuming a binomial distribution and did random-effects meta-regression of log-transformed sensitivity and specificity estimates for diagnostic value. We assessed the heterogeneity of papers included in these meta-analyses using the I 2 statistic and evaluated publication bias using funnel plots. This review is registered with PROSPERO (CRD42017063896). Findings 3649 papers were identified and 60 studies were included for analyses: 13 for mortality, 27 for diagnostic value, and 20 for treatment. Shigella infection was associated with mortality (pooled OR 2·8, 95% CI 1·6–4·8; p=0·000) whereas dysentery was not associated with mortality (1·3, 0·7–2·3; p=0·37). Between 1977 and 2016, dysentery identified 1·9–85·9% of confirmed Shigella infections, with sensitivity decreasing over time (p=0·04). Ten (50%) of 20 included antibiotic trials were among children with dysentery, none were placebo-controlled, and two (10%) evaluated antibiotics no longer recommended for acute infectious diarrhoea. Ciprofloxacin showed superior microbiological, but not clinical, effectiveness compared with pivmecillinam, and no superior microbiological and clinical effectiveness compared with gatifloxacin. Substantial heterogeneity was reported for meta-analyses of the Shigella -associated mortality studies ( I 2 =78·3%) and dysentery-associated mortality studies ( I 2 =73·2%). Too few mortality studies were identified to meaningfully test for publication bias. No evidence of publication bias was found in this analysis of studies of diagnostic value. Interpretation Current WHO guidelines appear to manage dysentery effectively, but might miss opportunities to reduce mortality among children infected with Shigella who present without bloody stool. Further studies should quantify potential decreases in mortality and morbidity associated with antibiotic therapy for children with non-dysenteric Shigella infection. Funding Bill & Melinda Gates Foundation and the Center for AIDS Research International Core.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,009
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,027
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,048

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0090,027
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0140,019
Bibliométrie0,0060,007
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,098
Tête enseignante GPT0,444
Écart entre enseignants0,346 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations117
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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