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Enregistrement W2767300965 · doi:10.1038/s41467-017-01615-z

Novel genetically encoded fluorescent probes enable real-time detection of potassium in vitro and in vivo

2017· article· en· W2767300965 sur OpenAlexfundno aff
Helmut Bischof, Markus Rehberg, Sarah Stryeck, Katharina Artinger, Emrah Eroğlu, Markus Waldeck‐Weiermair, Benjamin Gottschalk, René Rost, András T. Deak, Tobias Niedrist, Nemanja Vujić, Hanna Lindermuth, Ruth Prassl, Brigitte Pelzmann, Klaus Groschner, Dagmar Kratky, Kathrin Eller, Alexander R. Rosenkranz, Tobias Madl, Nikolaus Plesnila, Wolfgang F. Graier, Roland Malli

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineChemical Engineering
ThématiqueAnalytical Chemistry and Sensors
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of North Carolina at Chapel HillKarl-Franzens-Universität GrazBioTechMed-GrazMedizinische Universität GrazAustrian Science FundSchool of Medicine, Duke UniversityUniversity of Alberta
Mots-clésFörster resonance energy transferExtracellularIntracellularIn vivoLive cell imagingOrganelleBiophysicsCell biologyFluorescenceFluorescence microscopeMicroscopyBiologyConfocal microscopyCellChemistryBiochemistryPathologyPhysicsGeneticsMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Changes in intra- and extracellular potassium ion (K + ) concentrations control many important cellular processes and related biological functions. However, our current understanding of the spatiotemporal patterns of physiological and pathological K + changes is severely limited by the lack of practicable detection methods. We developed K + -sensitive genetically encoded, Förster resonance energy transfer-(FRET) based probes, called GEPIIs, which enable quantitative real-time imaging of K + dynamics. GEPIIs as purified biosensors are suitable to directly and precisely quantify K + levels in different body fluids and cell growth media. GEPIIs expressed in cells enable time-lapse and real-time recordings of global and local intracellular K + signals. Hitherto unknown Ca 2+ -triggered, organelle-specific K + changes were detected in pancreatic beta cells. Recombinant GEPIIs also enabled visualization of extracellular K + fluctuations in vivo with 2-photon microscopy. Therefore, GEPIIs are relevant for diverse K + assays and open new avenues for live-cell K + imaging.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations182
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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