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Towards a genomics-informed, real-time, global pathogen surveillance system

2017· review· en· 801 citations· W2767318416 sur OpenAlex· 10.1038/nrg.2017.88

Pourquoi ce travail est-il dans la base ?

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

Affiliation canadienneUne personne signataire a déclaré un établissement canadien. C'est la seule voie dont dispose la base habituelle.

Prédiction distillée sur la base complète

Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

Catégories candidates
Méta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuelles
aucune
Domaine
Signal candidat: aucuneSignal consensuel: aucune
Devis d'étude
Signal candidat: Sans objetSignal consensuel: aucune
Genre
Signal candidat: SynthèseSignal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants
0,948
Score d'incertitude au seuil
1,000
Statut de validation
machine_predicted_unvalidated · codex-gemma-dda1882f352a

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0070,002
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Tête enseignante Opus0,070
Tête enseignante GPT0,423
Écart entre enseignants
0,353 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Résumé

Next-generation sequencing has the potential to support public health surveillance systems to improve the early detection of emerging infectious diseases. This Review delineates the role of genomics in rapid outbreak response and the challenges that need to be tackled for genomics-informed pathogen surveillance to become a global reality. The recent Ebola and Zika epidemics demonstrate the need for the continuous surveillance, rapid diagnosis and real-time tracking of emerging infectious diseases. Fast, affordable sequencing of pathogen genomes — now a staple of the public health microbiology laboratory in well-resourced settings — can affect each of these areas. Coupling genomic diagnostics and epidemiology to innovative digital disease detection platforms raises the possibility of an open, global, digital pathogen surveillance system. When informed by a One Health approach, in which human, animal and environmental health are considered together, such a genomics-based system has profound potential to improve public health in settings lacking robust laboratory capacity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

La notice

Revue
Nature Reviews Genetics
Thématique
Zoonotic diseases and public health
Domaine
Medicine
Établissements canadiens
BC Centre for Disease ControlUniversity of British Columbia
Organismes subventionnaires
Medical Research Council
Mots-clés
GenomicsInfectious disease (medical specialty)Public healthBiologyData scienceDisease surveillancePublic health surveillanceCitizen scienceGlobal healthEpidemiological surveillanceComputational biologyGenomeDiseaseEpidemiologyComputer scienceGeneticsMedicineGenePathology
Résumé présent dans OpenAlex
oui