PATH-31. ELEVATION OF YKL-40, NORMALIZED TO CERULOPLASMIN, IN CEREBROSPINAL FLUID IS ASSOCIATED WITH GLIOBLASTOMA RECURRENCE
Notice bibliographique
Résumé
Enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) is a common tool to study single or a panel of biomarkers for glioblastoma (GBM) among body fluids including cerebrospinal fluid (CSF). Limitation of ELISA and blood contamination in CSF are challenging issues. In this study, 90 CSF samples were collected from lumbar puncture or Ommya reservoir from 60 patients, predominantly diagnosed of recurrent GBM and metastatic CNS tumors (Mets). There were repeated collections from 10 patients. Detection methods are immuno-blot and semi-quantitative mass spectrometric (MS) analysis. We found that immuno-blot showed GBM, but not metastatic CNS tumor (Mets), is associated with elevated chitiase-3-like protein 1 (YKL-40). However YKL-40 antibody from Quidel ELISA kit failed to detect YKL-40 purified protein by immune-blot. In a series analysis of CSF from the same patient, we detected YKL-40 elevation 2 months prior to radiographic evidence of GBM progression. YKL-40 from one subject’s CSF reduced after initiation of intrathecal chemotherapy and the level remained low until 3 months later when GBM progressed. We found that MS can detect more than 300 proteins from each sample. Ceruloplasmin (CP) is found having a narrower range of variation than serotransferrin or albumin. Normalized with CP, we found that YKL-40 (YKL-40/CP) was significantly higher in recurrent GBM group (1.12 ± 0.46; n=22) than Mets (0.54 ± 0.24; n=19) or non-tumor group (0.56 ± 0.19; n=16), p<0.05, respectively. In contrast, CSF total protein, glucose, normalized osteopontin and insulin like growth factor binding protein 2 showed no difference among groups. We conclude 1) MS is a useful tool to study GBM biomarkers in CSF; 2) CP is a better internal protein than albumin for normalization in CSF; 3) elevated YKL-40 is associated with GBM recurrence and it is a potential biomarker for early detection of disease progression.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».