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Enregistrement W2767507242 · doi:10.1101/209270

High genetic loading of schizophrenia predicts poor response to lithium in patients with bipolar disorder: A polygenic score and cross-trait genetic analysis

2017· preprint· en· W2767507242 sur OpenAlexaff
Azmeraw T. Amare, Klaus Oliver Schubert, Liping Hou, Scott R. Clark, Sergi Papiol, Urs Heilbronner, Franziska Degenhardt, Fasil Tekola‐Ayele, Yi-Hsiang Hsu, Tatyana Shekhtman, Mazda Adli, Nirmala Akula, Kazufumi Akiyama, Raffaella Ardau, Bárbara Arias, Jean-Michel Aubry, Lena Backlund, Abesh Kumar Bhattacharjee, Frank Bellivier, Antonio Benabarre, Susanne Bengesser, Joanna M. Biernacka, Armin Birner, Clara Brichant‐Petitjean, Pablo Cervantes, y Hsi-Chung, Caterina Chillotti, Sven Cichon, Cristiana Cruceanu, Piotr M. Czerski, Nina Dalkner, Alexandre Dayer, Maria Del Zompo, J. Raymond DePaulo, Bruno Étain, Peter Falkai, Andreas J. Forstner, Louise Frisén, Mark A. Frye, Janice M. Fullerton, Sébastien Gard, Julie Garnham, Fernando S. Goes, Maria Grigoroiu‐Serbânescu, Paul Grof, Ryota Hashimoto, Joanna Hauser, Stefan Herms, Per Hoffmann, Andrea Hofmann, Stéphane Jamain, Esther Jiménez, Jean‐Pierre Kahn, Layla Kassem, Po‐Hsiu Kuo, Tadafumi Kato, John R. Kelsoe, Sarah Kittel‐Schneider, Sebastian Kliwicki, Barbara König, Ichiro Kusumi, Gonzalo Laje, Mikael Landén, Catharina Lavebratt, Marion Leboyer, Susan G. Leckband, Alfonso Tortorella, Mirko Manchia, Lina Martinsson, Michael J. McCarthy, Susan L. McElroy, Francesc Colom, Marina Mitjans, Francis M. Mondimore, Palmiero Monteleone, Caroline M. Nievergelt, Markus M. Nöthen, Tomáš Novák, Claire O’Donovan, Norio Ozaki, Urban Ösby, Andrea Pfennig, James B. Potash, Andreas Reif, Eva Z. Reininghaus, Guy A. Rouleau, Janusz Rybakowski, Martin Schalling, Peter R. Schofield, Barbara Schweizer, Giovanni Severino, Paul D. Shilling, Katzutaka Shimoda, Christian Simhandl, Claire Slaney, Alessio Squassina, Thomas Stamm, Pavla Stopková, Mario Maj, Gustavo Turecki, Eduard Vieta, Julia Volkert, Stephanie H. Witt, A. Jordan Wright, Peter P. Zandi, Philip B. Mitchell, Michael Bauer, Martin Alda, Marcella Rietschel, Bernhard T. Baune

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2017
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBipolar Disorder and Treatment
Établissements canadiensCentre for Movement DisordersMcGill UniversityDouglas Mental Health University InstituteMcGill University Health CentreDalhousie UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesBundesministerium für Bildung und ForschungUniversity of AdelaideNational Institute of Mental HealthDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésGenome-wide association studyBipolar disorderGenetic associationLithium (medication)Internal medicineSchizophrenia (object-oriented programming)Odds ratioMood stabilizerOncologyMedicinePsychologyClinical psychologyPsychiatryGenotypeGeneticsSingle-nucleotide polymorphismBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Importance Lithium is a first-line mood stabilizer for the maintenance treatment of Bipolar Disorder (BPD). However, the efficacy of lithium varies widely, with a non-response rate of up to 30%. Biological response markers and predictors are lacking. Objective Genetic factors are thought to mediate lithium treatment response, and the previously reported genetic overlap between BPD and schizophrenia (SCZ) led us to test whether a polygenic score (PGS) for SCZ could predict lithium treatment response in BPD. Further, we explored the potential molecular underpinnings of this association. Design Weighted SCZ PGSs were computed at ten p-value thresholds (P T ) using summary statistics from a genome-wide association study (GWAS) of 36,989 SCZ cases, and genotype data for BPD patients from the Consortium on Lithium Genetics (ConLi + Gen). For functional exploration, we performed a cross-trait meta-GWAS and pathway analysis, combining GWAS summary statistics on SCZ and lithium treatment response. Setting International multicenter GWAS. Participants Patients with BPD who had undergone lithium treatment were genotyped and retrospectively assessed for long-term treatment response (n=2,586). Main outcome measures Clinical treatment response to lithium was defined on both the categorical and continuous scales using the ALDA score. The effect measures include odds ratios (ORs) and the proportion of variance explained (R 2 ), and a significant association was determined at p<0.05. Results The PGS for SCZ was inversely associated with lithium treatment response in the categorical outcome (p=8×10 −5 ), at P T <5×10 −2 . Patients with BPD who had low polygenic load for SCZ responded better to lithium, with ORs for lithium response ranging from 3.46 [95%CI: 1.42-8.41 at 1 st decile] to 2.03 [95%CI: 0.86-4.81 at the 9th decile], compared to the patients in the 10 th decile of SCZ risk. In the cross-trait meta-GWAS, 15 genetic loci that may have overlapping effects on lithium treatment response and susceptibility to SCZ were identified. Functional pathway and network analysis of these loci point to the HLA complex and inflammatory cytokines (TNFα, IL-4, IFNγ) as molecular contributors to lithium treatment response in BPD. Conclusions and Relevance The study provides, for the first-time, evidence for a negative association between high genetic loading for SCZ and poor response to lithium in patients with BPD. These results suggest the potential for translational research aimed at personalized prescribing of lithium. Key Points Question Does a polygenic score for Schizophrenia (SCZ) predict response to lithium in patients with Bipolar Disorder (BPD)? What are the molecular drivers of the association between SCZ and lithium treatment response? Findings We found an inverse association between genetic loading for SCZ risk variants and response to lithium in patients with BPD. Genetic variants in the HLA region on chromosome 6, the antigen presentation pathway and markers of inflammation (TNFα, IL-4, IFNγ) point to molecular underpinnings of lithium treatment response in BPD. Meaning In patients with BPD, an assessment of a polygenic load for SCZ risk variants may assist in conjunction with clinical data to predict whether they would respond to lithium treatment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission1
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