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Enregistrement W2767599002 · doi:10.1093/neuonc/nox168.1101

SCDT-18. EXPRESSION OF ABC TRANSPORTERS AS PROGNOSTIC BIOMARKERS FOR GLIOBLASTOMA

2017· article· en· W2767599002 sur OpenAlexaff
Laurent-Olivier Roy, M. Lemelin, Marie-Belle Poirier, Marie Blanchette, David Fortin

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDrug Transport and Resistance Mechanisms
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGlioblastomaATP-binding cassette transporterTransporterExpression (computer science)Computational biologyCancer researchBiologyComputer scienceGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Glioblastoma (GBM) is the most common and aggressive malignant primary brain tumour in adults. Standard therapy, consisting in surgery followed by concomitant radio- and chemotherapy, only offers palliative benefits. Indeed, recurrence is inevitable and this disease remains incurable with an overall survival of 14.6 months. We believe that the chemoresistant phenotype of GBM is supported by their expression of several efflux pumps (ABC transporters). We thus hypothesized that gene expression of these transporters could correlate with patients clinical surrogates and be used as prognostic biomarkers. We investigated the expression of ABCB1, ABCC1, ABCC3 and ABCG2 by qPCR in 159 GBM specimens collected during surgery and 22 non-tumoral brain tissue. With the exception of ABCB1, all three efflux pumps were significantly overexpressed in GBM. While ABCB1 had no effect on clinical surrogates, ABCC1 and ABCC3 expression correlated with drastically shorter overall survival (OS) and progression-free survival (PFS) in newly diagnosed patients. Moreover, our multivariate analysis showed that patients with high and moderate levels of ABCC3 had a considerably poorer prognosis than patients with low expressing tumours (hazard ratio [95% CI] was 2.424 [1.340 - 4.531]; p<0.001). However, in recurrent tumours, these transporters showed no correlation with clinical outcome. Interestingly, high ABCG2 expression correlated with better prognosis in both newly diagnosed and recurrent tumours (hazard ratio [95% CI] was 0.564 [0.323 - 0.986]; p=0.044). This study shows that ABCC1, ABCC3 and ABCG2 transporters are upregulated in GBM tumours. Moreover, our data suggest that expression of these efflux pumps could be quantified upon diagnosis and serve as prognostic biomarkers for GBM patients. Therefore, we truly feel that ABCC1, ABCC3 and ABCG2 expression levels could be used to influence treatment and clinical management of patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,319
Écart entre enseignants0,293 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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