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Enregistrement W2767800954 · doi:10.1111/aji.12781

Medroxyprogesterone acetate‐treated human, primary endometrial epithelial cells reveal unique gene expression signature linked to innate immunity and <scp>HIV</scp>‐1 susceptibility

2017· article· en· W2767800954 sur OpenAlexafffund
Matthew Woods, Muhammad Atif Zahoor, Sara Dizzell, Chris P. Verschoor, Charu Kaushic

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Reproductive Immunology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueReproductive tract infections research
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchOntario HIV Treatment Network
Mots-clésMedroxyprogesterone acetateInnate immune systemGene expressionBiologyProgestinEstrogenMicroarray analysis techniquesImmunologyHormoneEndometriumProgestogenImmunityGeneEndocrinologyInternal medicineImmune systemMedicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PROBLEM: Medroxyprogesterone acetate (MPA), a progestin-based hormonal contraceptive designed to mimic progesterone, has been linked to increased human immunodeficiency virus (HIV-1) susceptibility. Genital epithelial cells (GECs) form the mucosal lining of the female genital tract (FGT) and provide the first line of protection against HIV-1. The impact of endogenous sex hormones or MPA on the gene expression profile of GECs has not been comprehensively documented. METHOD OF STUDY: Using microarray analysis, we characterized the transcriptional profile of primary endometrial epithelial cells grown in physiological levels of E2, P4, and MPA. RESULTS: Each hormone treatment altered the gene expression profile of GECs in a unique manner. Interestingly, although MPA is a progestogen, the gene expression profile induced by it was distinct from P4. MPA increased gene expression of genes related to inflammation and cholesterol synthesis linked to innate immunity and HIV-1 susceptibility. CONCLUSION: The analysis of gene expression profiles provides insights into the effects of sex hormones and MPA on GECs and allows us to posit possible mechanisms of the MPA-mediated increase in HIV-1 acquisition.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,008
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Études des sciences et des technologies, Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesÉtudes des sciences et des technologies
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,279
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,008
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,005
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,296
Écart entre enseignants0,278 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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